Protein–RNA interactions for Protein: P97370

Atp1b3, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b3P97370 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Atp1b3P97370 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Atp1b3P97370 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Atp1b3P97370 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Atp1b3P97370 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Atp1b3P97370 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Atp1b3P97370 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Atp1b3P97370 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Atp1b3P97370 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Atp1b3P97370 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Atp1b3P97370 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Atp1b3P97370 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Atp1b3P97370 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Atp1b3P97370 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Atp1b3P97370 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Atp1b3P97370 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Atp1b3P97370 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Atp1b3P97370 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Atp1b3P97370 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Atp1b3P97370 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Atp1b3P97370 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Atp1b3P97370 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Atp1b3P97370 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Atp1b3P97370 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Atp1b3P97370 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Atp1b3P97370 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Atp1b3P97370 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Atp1b3P97370 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Atp1b3P97370 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Atp1b3P97370 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Atp1b3P97370 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Atp1b3P97370 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Atp1b3P97370 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Atp1b3P97370 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Atp1b3P97370 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Atp1b3P97370 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Atp1b3P97370 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Atp1b3P97370 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.08
Atp1b3P97370 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Atp1b3P97370 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Atp1b3P97370 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Atp1b3P97370 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Atp1b3P97370 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Atp1b3P97370 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Atp1b3P97370 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Atp1b3P97370 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Atp1b3P97370 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Atp1b3P97370 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Atp1b3P97370 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Atp1b3P97370 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Atp1b3P97370 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Atp1b3P97370 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Atp1b3P97370 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Atp1b3P97370 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Atp1b3P97370 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Atp1b3P97370 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Atp1b3P97370 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Atp1b3P97370 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Atp1b3P97370 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Atp1b3P97370 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Atp1b3P97370 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Atp1b3P97370 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Atp1b3P97370 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Atp1b3P97370 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Atp1b3P97370 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Atp1b3P97370 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Atp1b3P97370 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Atp1b3P97370 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Atp1b3P97370 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Atp1b3P97370 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Atp1b3P97370 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
Atp1b3P97370 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Atp1b3P97370 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Atp1b3P97370 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Atp1b3P97370 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Atp1b3P97370 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Atp1b3P97370 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Atp1b3P97370 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Atp1b3P97370 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Atp1b3P97370 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Atp1b3P97370 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Atp1b3P97370 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Atp1b3P97370 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Atp1b3P97370 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Atp1b3P97370 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Atp1b3P97370 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Atp1b3P97370 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Atp1b3P97370 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Atp1b3P97370 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Atp1b3P97370 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Atp1b3P97370 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Atp1b3P97370 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Atp1b3P97370 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Atp1b3P97370 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Atp1b3P97370 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Atp1b3P97370 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Atp1b3P97370 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Atp1b3P97370 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Atp1b3P97370 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Atp1b3P97370 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms