Protein–RNA interactions for Protein: P86449

Trim43c, Tripartite motif-containing protein 43C, mousemouse

Predictions only

Length 446 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim43cP86449 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trim43cP86449 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trim43cP86449 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trim43cP86449 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trim43cP86449 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trim43cP86449 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trim43cP86449 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trim43cP86449 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trim43cP86449 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trim43cP86449 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trim43cP86449 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trim43cP86449 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Trim43cP86449 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trim43cP86449 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trim43cP86449 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Trim43cP86449 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Trim43cP86449 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Trim43cP86449 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Trim43cP86449 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trim43cP86449 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Trim43cP86449 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trim43cP86449 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trim43cP86449 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trim43cP86449 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trim43cP86449 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trim43cP86449 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trim43cP86449 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trim43cP86449 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trim43cP86449 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trim43cP86449 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trim43cP86449 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Trim43cP86449 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Trim43cP86449 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Trim43cP86449 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Trim43cP86449 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Trim43cP86449 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Trim43cP86449 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trim43cP86449 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trim43cP86449 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trim43cP86449 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trim43cP86449 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trim43cP86449 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trim43cP86449 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trim43cP86449 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trim43cP86449 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trim43cP86449 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trim43cP86449 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Trim43cP86449 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trim43cP86449 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trim43cP86449 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Trim43cP86449 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Trim43cP86449 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Trim43cP86449 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Trim43cP86449 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Trim43cP86449 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trim43cP86449 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trim43cP86449 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trim43cP86449 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trim43cP86449 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Trim43cP86449 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trim43cP86449 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trim43cP86449 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trim43cP86449 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trim43cP86449 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Trim43cP86449 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trim43cP86449 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trim43cP86449 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trim43cP86449 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trim43cP86449 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trim43cP86449 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trim43cP86449 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trim43cP86449 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trim43cP86449 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trim43cP86449 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trim43cP86449 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trim43cP86449 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trim43cP86449 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trim43cP86449 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trim43cP86449 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trim43cP86449 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trim43cP86449 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trim43cP86449 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trim43cP86449 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Trim43cP86449 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trim43cP86449 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trim43cP86449 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Trim43cP86449 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trim43cP86449 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trim43cP86449 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trim43cP86449 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trim43cP86449 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trim43cP86449 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trim43cP86449 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trim43cP86449 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trim43cP86449 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trim43cP86449 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trim43cP86449 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trim43cP86449 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trim43cP86449 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trim43cP86449 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.9 ms