Protein–RNA interactions for Protein: P70459

Erf, ETS domain-containing transcription factor ERF, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ErfP70459 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ErfP70459 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ErfP70459 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ErfP70459 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ErfP70459 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ErfP70459 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ErfP70459 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
ErfP70459 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
ErfP70459 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ErfP70459 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ErfP70459 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ErfP70459 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ErfP70459 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ErfP70459 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ErfP70459 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ErfP70459 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ErfP70459 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
ErfP70459 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ErfP70459 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ErfP70459 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ErfP70459 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ErfP70459 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ErfP70459 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ErfP70459 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ErfP70459 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ErfP70459 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ErfP70459 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ErfP70459 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ErfP70459 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ErfP70459 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ErfP70459 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ErfP70459 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ErfP70459 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ErfP70459 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ErfP70459 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ErfP70459 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ErfP70459 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ErfP70459 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ErfP70459 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ErfP70459 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ErfP70459 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ErfP70459 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ErfP70459 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
ErfP70459 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ErfP70459 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ErfP70459 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ErfP70459 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ErfP70459 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ErfP70459 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ErfP70459 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ErfP70459 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ErfP70459 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ErfP70459 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ErfP70459 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ErfP70459 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
ErfP70459 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
ErfP70459 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ErfP70459 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ErfP70459 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ErfP70459 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ErfP70459 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ErfP70459 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ErfP70459 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ErfP70459 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ErfP70459 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ErfP70459 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ErfP70459 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ErfP70459 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ErfP70459 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ErfP70459 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ErfP70459 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ErfP70459 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ErfP70459 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ErfP70459 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ErfP70459 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ErfP70459 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ErfP70459 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ErfP70459 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ErfP70459 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
ErfP70459 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ErfP70459 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ErfP70459 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ErfP70459 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ErfP70459 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ErfP70459 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ErfP70459 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ErfP70459 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ErfP70459 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ErfP70459 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ErfP70459 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ErfP70459 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ErfP70459 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ErfP70459 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ErfP70459 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ErfP70459 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ErfP70459 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ErfP70459 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ErfP70459 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ErfP70459 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
ErfP70459 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms