Protein–RNA interactions for Protein: P70338

Gfi1, Zinc finger protein Gfi-1, mousemouse

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfi1P70338 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gfi1P70338 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gfi1P70338 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gfi1P70338 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gfi1P70338 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Gfi1P70338 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gfi1P70338 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gfi1P70338 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gfi1P70338 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gfi1P70338 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gfi1P70338 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gfi1P70338 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gfi1P70338 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gfi1P70338 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gfi1P70338 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gfi1P70338 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gfi1P70338 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gfi1P70338 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gfi1P70338 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Gfi1P70338 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gfi1P70338 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gfi1P70338 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gfi1P70338 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gfi1P70338 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.99
Gfi1P70338 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Gfi1P70338 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gfi1P70338 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gfi1P70338 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gfi1P70338 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gfi1P70338 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gfi1P70338 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gfi1P70338 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gfi1P70338 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gfi1P70338 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gfi1P70338 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gfi1P70338 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gfi1P70338 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gfi1P70338 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gfi1P70338 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gfi1P70338 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gfi1P70338 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gfi1P70338 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gfi1P70338 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gfi1P70338 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gfi1P70338 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gfi1P70338 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gfi1P70338 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gfi1P70338 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gfi1P70338 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gfi1P70338 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gfi1P70338 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gfi1P70338 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gfi1P70338 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gfi1P70338 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gfi1P70338 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gfi1P70338 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gfi1P70338 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gfi1P70338 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gfi1P70338 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gfi1P70338 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Gfi1P70338 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Gfi1P70338 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Gfi1P70338 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gfi1P70338 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gfi1P70338 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gfi1P70338 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gfi1P70338 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gfi1P70338 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gfi1P70338 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gfi1P70338 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gfi1P70338 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gfi1P70338 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gfi1P70338 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gfi1P70338 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gfi1P70338 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gfi1P70338 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gfi1P70338 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gfi1P70338 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gfi1P70338 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gfi1P70338 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gfi1P70338 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Gfi1P70338 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gfi1P70338 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Gfi1P70338 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gfi1P70338 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gfi1P70338 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gfi1P70338 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gfi1P70338 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gfi1P70338 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gfi1P70338 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gfi1P70338 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gfi1P70338 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gfi1P70338 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gfi1P70338 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gfi1P70338 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gfi1P70338 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gfi1P70338 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gfi1P70338 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gfi1P70338 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
Gfi1P70338 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms