Protein–RNA interactions for Protein: P70298

Cux2, Homeobox protein cut-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cux2P70298 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
Cux2P70298 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
Cux2P70298 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC38.16■■■■□ 3.7
Cux2P70298 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC38.16■■■■□ 3.7
Cux2P70298 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC38.16■■■■□ 3.7
Cux2P70298 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
Cux2P70298 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC38.15■■■■□ 3.7
Cux2P70298 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
Cux2P70298 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
Cux2P70298 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC38.14■■■■□ 3.7
Cux2P70298 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
Cux2P70298 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC38.12■■■■□ 3.69
Cux2P70298 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC38.12■■■■□ 3.69
Cux2P70298 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
Cux2P70298 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
Cux2P70298 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38.12■■■■□ 3.69
Cux2P70298 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
Cux2P70298 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC38.11■■■■□ 3.69
Cux2P70298 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
Cux2P70298 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.1■■■■□ 3.69
Cux2P70298 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC38.1■■■■□ 3.69
Cux2P70298 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
Cux2P70298 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC38.09■■■■□ 3.69
Cux2P70298 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC38.09■■■■□ 3.69
Cux2P70298 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
Cux2P70298 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC38.07■■■■□ 3.69
Cux2P70298 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.69
Cux2P70298 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC38.06■■■■□ 3.68
Cux2P70298 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC38.06■■■■□ 3.68
Cux2P70298 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
Cux2P70298 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
Cux2P70298 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
Cux2P70298 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
Cux2P70298 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
Cux2P70298 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
Cux2P70298 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC38.04■■■■□ 3.68
Cux2P70298 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
Cux2P70298 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.04■■■■□ 3.68
Cux2P70298 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC38.03■■■■□ 3.68
Cux2P70298 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
Cux2P70298 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC38.02■■■■□ 3.68
Cux2P70298 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.02■■■■□ 3.68
Cux2P70298 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC38.01■■■■□ 3.68
Cux2P70298 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.67
Cux2P70298 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
Cux2P70298 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
Cux2P70298 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.99■■■■□ 3.67
Cux2P70298 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC37.99■■■■□ 3.67
Cux2P70298 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC37.98■■■■□ 3.67
Cux2P70298 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
Cux2P70298 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.97■■■■□ 3.67
Cux2P70298 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
Cux2P70298 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
Cux2P70298 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC37.95■■■■□ 3.67
Cux2P70298 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.95■■■■□ 3.67
Cux2P70298 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
Cux2P70298 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
Cux2P70298 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.95■■■■□ 3.67
Cux2P70298 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
Cux2P70298 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC37.94■■■■□ 3.66
Cux2P70298 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
Cux2P70298 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
Cux2P70298 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.92■■■■□ 3.66
Cux2P70298 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
Cux2P70298 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
Cux2P70298 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
Cux2P70298 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
Cux2P70298 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
Cux2P70298 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC37.89■■■■□ 3.66
Cux2P70298 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC37.89■■■■□ 3.66
Cux2P70298 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC37.89■■■■□ 3.66
Cux2P70298 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
Cux2P70298 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
Cux2P70298 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC37.87■■■■□ 3.65
Cux2P70298 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
Cux2P70298 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
Cux2P70298 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC37.86■■■■□ 3.65
Cux2P70298 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.86■■■■□ 3.65
Cux2P70298 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC37.86■■■■□ 3.65
Cux2P70298 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
Cux2P70298 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
Cux2P70298 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
Cux2P70298 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC37.84■■■■□ 3.65
Cux2P70298 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
Cux2P70298 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC37.84■■■■□ 3.65
Cux2P70298 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
Cux2P70298 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
Cux2P70298 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC37.83■■■■□ 3.65
Cux2P70298 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
Cux2P70298 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
Cux2P70298 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.65
Cux2P70298 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC37.82■■■■□ 3.64
Cux2P70298 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.64
Cux2P70298 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
Cux2P70298 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
Cux2P70298 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
Cux2P70298 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
Cux2P70298 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
Cux2P70298 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
Cux2P70298 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC37.79■■■■□ 3.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms