Protein–RNA interactions for Protein: P70213

Fv1, Friend virus susceptibility protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fv1P70213 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Fv1P70213 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Fv1P70213 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Fv1P70213 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Fv1P70213 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Fv1P70213 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Fv1P70213 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Fv1P70213 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Fv1P70213 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Fv1P70213 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Fv1P70213 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Fv1P70213 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Fv1P70213 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Fv1P70213 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Fv1P70213 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Fv1P70213 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fv1P70213 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fv1P70213 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fv1P70213 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fv1P70213 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fv1P70213 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fv1P70213 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Fv1P70213 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Fv1P70213 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Fv1P70213 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Fv1P70213 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Fv1P70213 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Fv1P70213 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Fv1P70213 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Fv1P70213 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Fv1P70213 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Fv1P70213 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Fv1P70213 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Fv1P70213 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Fv1P70213 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Fv1P70213 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Fv1P70213 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Fv1P70213 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Fv1P70213 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Fv1P70213 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Fv1P70213 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Fv1P70213 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Fv1P70213 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Fv1P70213 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Fv1P70213 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Fv1P70213 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Fv1P70213 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Fv1P70213 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Fv1P70213 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Fv1P70213 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Fv1P70213 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Fv1P70213 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Fv1P70213 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Fv1P70213 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Fv1P70213 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Fv1P70213 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Fv1P70213 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Fv1P70213 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Fv1P70213 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Fv1P70213 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Fv1P70213 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Fv1P70213 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Fv1P70213 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Fv1P70213 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Fv1P70213 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Fv1P70213 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Fv1P70213 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Fv1P70213 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Fv1P70213 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Fv1P70213 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Fv1P70213 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Fv1P70213 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Fv1P70213 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Fv1P70213 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fv1P70213 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fv1P70213 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fv1P70213 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fv1P70213 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fv1P70213 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fv1P70213 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Fv1P70213 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Fv1P70213 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Fv1P70213 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Fv1P70213 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Fv1P70213 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Fv1P70213 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Fv1P70213 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Fv1P70213 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Fv1P70213 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Fv1P70213 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Fv1P70213 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Fv1P70213 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Fv1P70213 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Fv1P70213 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Fv1P70213 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Fv1P70213 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Fv1P70213 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Fv1P70213 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Fv1P70213 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Fv1P70213 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms