Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SbdsP70122 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SbdsP70122 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SbdsP70122 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SbdsP70122 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SbdsP70122 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SbdsP70122 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SbdsP70122 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SbdsP70122 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SbdsP70122 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SbdsP70122 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SbdsP70122 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SbdsP70122 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SbdsP70122 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SbdsP70122 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SbdsP70122 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SbdsP70122 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SbdsP70122 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SbdsP70122 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SbdsP70122 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SbdsP70122 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SbdsP70122 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SbdsP70122 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SbdsP70122 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SbdsP70122 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SbdsP70122 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SbdsP70122 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SbdsP70122 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SbdsP70122 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SbdsP70122 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SbdsP70122 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SbdsP70122 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SbdsP70122 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SbdsP70122 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SbdsP70122 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SbdsP70122 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SbdsP70122 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SbdsP70122 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SbdsP70122 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SbdsP70122 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SbdsP70122 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SbdsP70122 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SbdsP70122 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SbdsP70122 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SbdsP70122 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SbdsP70122 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SbdsP70122 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SbdsP70122 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SbdsP70122 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SbdsP70122 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SbdsP70122 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SbdsP70122 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SbdsP70122 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SbdsP70122 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SbdsP70122 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SbdsP70122 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SbdsP70122 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SbdsP70122 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SbdsP70122 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SbdsP70122 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SbdsP70122 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SbdsP70122 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SbdsP70122 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SbdsP70122 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SbdsP70122 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SbdsP70122 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SbdsP70122 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SbdsP70122 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SbdsP70122 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SbdsP70122 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SbdsP70122 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SbdsP70122 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SbdsP70122 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SbdsP70122 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SbdsP70122 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SbdsP70122 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SbdsP70122 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SbdsP70122 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SbdsP70122 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SbdsP70122 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SbdsP70122 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SbdsP70122 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SbdsP70122 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SbdsP70122 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SbdsP70122 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SbdsP70122 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SbdsP70122 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SbdsP70122 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SbdsP70122 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SbdsP70122 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SbdsP70122 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SbdsP70122 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SbdsP70122 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SbdsP70122 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SbdsP70122 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SbdsP70122 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SbdsP70122 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SbdsP70122 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SbdsP70122 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SbdsP70122 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms