Protein–RNA interactions for Protein: P63163

Snrpn, Small nuclear ribonucleoprotein-associated protein N, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpnP63163 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SnrpnP63163 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SnrpnP63163 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SnrpnP63163 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SnrpnP63163 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SnrpnP63163 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SnrpnP63163 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SnrpnP63163 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SnrpnP63163 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SnrpnP63163 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SnrpnP63163 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SnrpnP63163 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SnrpnP63163 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SnrpnP63163 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SnrpnP63163 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SnrpnP63163 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SnrpnP63163 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SnrpnP63163 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SnrpnP63163 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SnrpnP63163 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SnrpnP63163 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SnrpnP63163 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SnrpnP63163 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
SnrpnP63163 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SnrpnP63163 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SnrpnP63163 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SnrpnP63163 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SnrpnP63163 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SnrpnP63163 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SnrpnP63163 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SnrpnP63163 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SnrpnP63163 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SnrpnP63163 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SnrpnP63163 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SnrpnP63163 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SnrpnP63163 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SnrpnP63163 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SnrpnP63163 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SnrpnP63163 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SnrpnP63163 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SnrpnP63163 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SnrpnP63163 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SnrpnP63163 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SnrpnP63163 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SnrpnP63163 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SnrpnP63163 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SnrpnP63163 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SnrpnP63163 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SnrpnP63163 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SnrpnP63163 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
SnrpnP63163 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SnrpnP63163 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SnrpnP63163 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SnrpnP63163 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SnrpnP63163 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SnrpnP63163 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SnrpnP63163 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SnrpnP63163 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SnrpnP63163 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21■□□□□ 0.95
SnrpnP63163 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21■□□□□ 0.95
SnrpnP63163 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SnrpnP63163 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SnrpnP63163 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
SnrpnP63163 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SnrpnP63163 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SnrpnP63163 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SnrpnP63163 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SnrpnP63163 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SnrpnP63163 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SnrpnP63163 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SnrpnP63163 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SnrpnP63163 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SnrpnP63163 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SnrpnP63163 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SnrpnP63163 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
SnrpnP63163 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SnrpnP63163 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SnrpnP63163 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SnrpnP63163 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SnrpnP63163 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SnrpnP63163 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SnrpnP63163 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SnrpnP63163 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SnrpnP63163 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SnrpnP63163 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SnrpnP63163 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SnrpnP63163 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SnrpnP63163 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SnrpnP63163 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SnrpnP63163 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SnrpnP63163 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SnrpnP63163 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SnrpnP63163 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SnrpnP63163 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SnrpnP63163 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SnrpnP63163 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SnrpnP63163 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SnrpnP63163 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SnrpnP63163 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SnrpnP63163 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.7 ms