Protein–RNA interactions for Protein: P63058

Thra, Thyroid hormone receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ThraP63058 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ThraP63058 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ThraP63058 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ThraP63058 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ThraP63058 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ThraP63058 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ThraP63058 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ThraP63058 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ThraP63058 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ThraP63058 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ThraP63058 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ThraP63058 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ThraP63058 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ThraP63058 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ThraP63058 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ThraP63058 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ThraP63058 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ThraP63058 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ThraP63058 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ThraP63058 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ThraP63058 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ThraP63058 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ThraP63058 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ThraP63058 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ThraP63058 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ThraP63058 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ThraP63058 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ThraP63058 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ThraP63058 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ThraP63058 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ThraP63058 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ThraP63058 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ThraP63058 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ThraP63058 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ThraP63058 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ThraP63058 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ThraP63058 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ThraP63058 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ThraP63058 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ThraP63058 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ThraP63058 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ThraP63058 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ThraP63058 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ThraP63058 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ThraP63058 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ThraP63058 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ThraP63058 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ThraP63058 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ThraP63058 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ThraP63058 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ThraP63058 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ThraP63058 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ThraP63058 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ThraP63058 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ThraP63058 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ThraP63058 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ThraP63058 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ThraP63058 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ThraP63058 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ThraP63058 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ThraP63058 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ThraP63058 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ThraP63058 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ThraP63058 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ThraP63058 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ThraP63058 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ThraP63058 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ThraP63058 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ThraP63058 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ThraP63058 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ThraP63058 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ThraP63058 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ThraP63058 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ThraP63058 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ThraP63058 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ThraP63058 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ThraP63058 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ThraP63058 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ThraP63058 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ThraP63058 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ThraP63058 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ThraP63058 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ThraP63058 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ThraP63058 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ThraP63058 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ThraP63058 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ThraP63058 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ThraP63058 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ThraP63058 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ThraP63058 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ThraP63058 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ThraP63058 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ThraP63058 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ThraP63058 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ThraP63058 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ThraP63058 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ThraP63058 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ThraP63058 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ThraP63058 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ThraP63058 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms