Protein–RNA interactions for Protein: P62858

Rps28, 40S ribosomal protein S28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 69 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps28P62858 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13,49□□□□□ -0,25
Rps28P62858 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13,49□□□□□ -0,25
Rps28P62858 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,49□□□□□ -0,25
Rps28P62858 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC13,49□□□□□ -0,25
Rps28P62858 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,49□□□□□ -0,25
Rps28P62858 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13,49□□□□□ -0,25
Rps28P62858 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC13,49□□□□□ -0,25
Rps28P62858 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,48□□□□□ -0,25
Rps28P62858 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,48□□□□□ -0,25
Rps28P62858 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC13,48□□□□□ -0,25
Rps28P62858 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,48□□□□□ -0,25
Rps28P62858 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,48□□□□□ -0,25
Rps28P62858 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13,48□□□□□ -0,25
Rps28P62858 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC13,48□□□□□ -0,25
Rps28P62858 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13,47□□□□□ -0,25
Rps28P62858 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC13,47□□□□□ -0,25
Rps28P62858 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC13,47□□□□□ -0,25
Rps28P62858 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC13,47□□□□□ -0,25
Rps28P62858 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC13,47□□□□□ -0,25
Rps28P62858 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC13,47□□□□□ -0,25
Rps28P62858 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC13,46□□□□□ -0,25
Rps28P62858 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,46□□□□□ -0,25
Rps28P62858 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,46□□□□□ -0,25
Rps28P62858 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13,46□□□□□ -0,25
Rps28P62858 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC13,46□□□□□ -0,25
Rps28P62858 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,46□□□□□ -0,25
Rps28P62858 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC13,46□□□□□ -0,26
Rps28P62858 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13,46□□□□□ -0,26
Rps28P62858 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,45□□□□□ -0,26
Rps28P62858 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,45□□□□□ -0,26
Rps28P62858 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13,45□□□□□ -0,26
Rps28P62858 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13,45□□□□□ -0,26
Rps28P62858 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,45□□□□□ -0,26
Rps28P62858 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,45□□□□□ -0,26
Rps28P62858 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13,44□□□□□ -0,26
Rps28P62858 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13,44□□□□□ -0,26
Rps28P62858 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13,44□□□□□ -0,26
Rps28P62858 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,44□□□□□ -0,26
Rps28P62858 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC13,44□□□□□ -0,26
Rps28P62858 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,44□□□□□ -0,26
Rps28P62858 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC13,44□□□□□ -0,26
Rps28P62858 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC13,44□□□□□ -0,26
Rps28P62858 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13,43□□□□□ -0,26
Rps28P62858 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13,43□□□□□ -0,26
Rps28P62858 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,43□□□□□ -0,26
Rps28P62858 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,43□□□□□ -0,26
Rps28P62858 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13,43□□□□□ -0,26
Rps28P62858 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,43□□□□□ -0,26
Rps28P62858 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,43□□□□□ -0,26
Rps28P62858 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC13,42□□□□□ -0,26
Rps28P62858 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,42□□□□□ -0,26
Rps28P62858 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC13,42□□□□□ -0,26
Rps28P62858 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13,42□□□□□ -0,26
Rps28P62858 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13,42□□□□□ -0,26
Rps28P62858 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,41□□□□□ -0,26
Rps28P62858 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC13,41□□□□□ -0,26
Rps28P62858 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13,41□□□□□ -0,26
Rps28P62858 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC13,41□□□□□ -0,26
Rps28P62858 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,41□□□□□ -0,26
Rps28P62858 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,41□□□□□ -0,26
Rps28P62858 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13,4□□□□□ -0,26
Rps28P62858 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC13,4□□□□□ -0,26
Rps28P62858 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,4□□□□□ -0,26
Rps28P62858 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,4□□□□□ -0,26
Rps28P62858 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC13,4□□□□□ -0,26
Rps28P62858 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,4□□□□□ -0,26
Rps28P62858 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13,4□□□□□ -0,27
Rps28P62858 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13,39□□□□□ -0,27
Rps28P62858 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13,39□□□□□ -0,27
Rps28P62858 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,39□□□□□ -0,27
Rps28P62858 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,39□□□□□ -0,27
Rps28P62858 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13,39□□□□□ -0,27
Rps28P62858 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC13,39□□□□□ -0,27
Rps28P62858 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13,39□□□□□ -0,27
Rps28P62858 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13,39□□□□□ -0,27
Rps28P62858 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13,39□□□□□ -0,27
Rps28P62858 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,38□□□□□ -0,27
Rps28P62858 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,38□□□□□ -0,27
Rps28P62858 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC13,38□□□□□ -0,27
Rps28P62858 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,38□□□□□ -0,27
Rps28P62858 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13,38□□□□□ -0,27
Rps28P62858 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13,37□□□□□ -0,27
Rps28P62858 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,37□□□□□ -0,27
Rps28P62858 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,37□□□□□ -0,27
Rps28P62858 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13,37□□□□□ -0,27
Rps28P62858 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,37□□□□□ -0,27
Rps28P62858 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,37□□□□□ -0,27
Rps28P62858 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,37□□□□□ -0,27
Rps28P62858 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,37□□□□□ -0,27
Rps28P62858 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,37□□□□□ -0,27
Rps28P62858 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13,36□□□□□ -0,27
Rps28P62858 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13,36□□□□□ -0,27
Rps28P62858 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,36□□□□□ -0,27
Rps28P62858 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,36□□□□□ -0,27
Rps28P62858 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,36□□□□□ -0,27
Rps28P62858 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC13,36□□□□□ -0,27
Rps28P62858 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13,35□□□□□ -0,27
Rps28P62858 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,35□□□□□ -0,27
Rps28P62858 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,35□□□□□ -0,27
Rps28P62858 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC13,35□□□□□ -0,27
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