Protein–RNA interactions for Protein: P62751

Rpl23a, 60S ribosomal protein L23a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl23aP62751 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Rpl23aP62751 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rpl23aP62751 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Rpl23aP62751 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rpl23aP62751 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rpl23aP62751 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rpl23aP62751 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rpl23aP62751 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rpl23aP62751 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rpl23aP62751 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rpl23aP62751 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rpl23aP62751 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rpl23aP62751 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rpl23aP62751 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rpl23aP62751 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rpl23aP62751 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rpl23aP62751 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rpl23aP62751 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rpl23aP62751 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rpl23aP62751 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rpl23aP62751 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rpl23aP62751 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rpl23aP62751 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rpl23aP62751 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rpl23aP62751 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rpl23aP62751 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rpl23aP62751 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rpl23aP62751 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rpl23aP62751 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rpl23aP62751 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rpl23aP62751 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rpl23aP62751 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rpl23aP62751 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rpl23aP62751 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rpl23aP62751 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rpl23aP62751 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rpl23aP62751 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rpl23aP62751 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rpl23aP62751 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rpl23aP62751 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rpl23aP62751 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rpl23aP62751 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rpl23aP62751 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rpl23aP62751 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rpl23aP62751 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rpl23aP62751 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rpl23aP62751 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rpl23aP62751 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rpl23aP62751 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rpl23aP62751 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rpl23aP62751 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rpl23aP62751 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rpl23aP62751 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rpl23aP62751 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rpl23aP62751 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rpl23aP62751 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rpl23aP62751 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rpl23aP62751 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rpl23aP62751 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rpl23aP62751 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Rpl23aP62751 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rpl23aP62751 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rpl23aP62751 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rpl23aP62751 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Rpl23aP62751 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rpl23aP62751 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rpl23aP62751 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rpl23aP62751 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rpl23aP62751 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rpl23aP62751 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rpl23aP62751 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rpl23aP62751 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rpl23aP62751 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rpl23aP62751 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rpl23aP62751 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rpl23aP62751 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rpl23aP62751 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rpl23aP62751 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rpl23aP62751 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rpl23aP62751 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rpl23aP62751 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rpl23aP62751 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rpl23aP62751 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rpl23aP62751 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rpl23aP62751 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rpl23aP62751 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rpl23aP62751 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rpl23aP62751 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rpl23aP62751 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rpl23aP62751 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rpl23aP62751 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rpl23aP62751 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rpl23aP62751 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rpl23aP62751 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rpl23aP62751 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rpl23aP62751 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rpl23aP62751 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rpl23aP62751 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rpl23aP62751 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rpl23aP62751 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.3 ms