Protein–RNA interactions for Protein: P61079

Ube2d3, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D3, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2d3P61079 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ube2d3P61079 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ube2d3P61079 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ube2d3P61079 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ube2d3P61079 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ube2d3P61079 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ube2d3P61079 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ube2d3P61079 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ube2d3P61079 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ube2d3P61079 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ube2d3P61079 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ube2d3P61079 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ube2d3P61079 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ube2d3P61079 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ube2d3P61079 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ube2d3P61079 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ube2d3P61079 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ube2d3P61079 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ube2d3P61079 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ube2d3P61079 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ube2d3P61079 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ube2d3P61079 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ube2d3P61079 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ube2d3P61079 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ube2d3P61079 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ube2d3P61079 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ube2d3P61079 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ube2d3P61079 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ube2d3P61079 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ube2d3P61079 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ube2d3P61079 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ube2d3P61079 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ube2d3P61079 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ube2d3P61079 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ube2d3P61079 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ube2d3P61079 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ube2d3P61079 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ube2d3P61079 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ube2d3P61079 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ube2d3P61079 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ube2d3P61079 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Ube2d3P61079 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ube2d3P61079 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ube2d3P61079 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ube2d3P61079 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ube2d3P61079 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ube2d3P61079 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ube2d3P61079 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ube2d3P61079 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ube2d3P61079 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ube2d3P61079 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ube2d3P61079 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ube2d3P61079 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ube2d3P61079 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ube2d3P61079 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ube2d3P61079 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ube2d3P61079 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ube2d3P61079 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ube2d3P61079 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ube2d3P61079 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ube2d3P61079 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ube2d3P61079 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ube2d3P61079 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ube2d3P61079 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ube2d3P61079 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ube2d3P61079 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ube2d3P61079 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ube2d3P61079 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ube2d3P61079 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ube2d3P61079 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ube2d3P61079 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ube2d3P61079 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ube2d3P61079 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ube2d3P61079 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ube2d3P61079 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ube2d3P61079 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ube2d3P61079 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ube2d3P61079 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ube2d3P61079 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ube2d3P61079 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ube2d3P61079 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ube2d3P61079 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ube2d3P61079 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ube2d3P61079 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ube2d3P61079 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ube2d3P61079 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ube2d3P61079 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ube2d3P61079 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ube2d3P61079 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ube2d3P61079 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ube2d3P61079 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ube2d3P61079 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ube2d3P61079 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ube2d3P61079 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ube2d3P61079 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ube2d3P61079 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ube2d3P61079 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ube2d3P61079 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ube2d3P61079 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ube2d3P61079 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.9 ms