Protein–RNA interactions for Protein: P59729

Rin3, Ras and Rab interactor 3, mousemouse

Predictions only

Length 980 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rin3P59729 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rin3P59729 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rin3P59729 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rin3P59729 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rin3P59729 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rin3P59729 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rin3P59729 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rin3P59729 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rin3P59729 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rin3P59729 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rin3P59729 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rin3P59729 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rin3P59729 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rin3P59729 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Rin3P59729 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Rin3P59729 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Rin3P59729 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Rin3P59729 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rin3P59729 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rin3P59729 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rin3P59729 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rin3P59729 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rin3P59729 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rin3P59729 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rin3P59729 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rin3P59729 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rin3P59729 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rin3P59729 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rin3P59729 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rin3P59729 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rin3P59729 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rin3P59729 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rin3P59729 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rin3P59729 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rin3P59729 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rin3P59729 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rin3P59729 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rin3P59729 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rin3P59729 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rin3P59729 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rin3P59729 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rin3P59729 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rin3P59729 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rin3P59729 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rin3P59729 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rin3P59729 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rin3P59729 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rin3P59729 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rin3P59729 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rin3P59729 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rin3P59729 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Rin3P59729 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rin3P59729 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rin3P59729 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rin3P59729 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rin3P59729 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rin3P59729 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rin3P59729 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rin3P59729 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rin3P59729 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rin3P59729 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rin3P59729 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rin3P59729 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Rin3P59729 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rin3P59729 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rin3P59729 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rin3P59729 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rin3P59729 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rin3P59729 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rin3P59729 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Rin3P59729 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rin3P59729 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rin3P59729 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rin3P59729 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rin3P59729 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rin3P59729 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rin3P59729 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rin3P59729 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rin3P59729 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rin3P59729 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Rin3P59729 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rin3P59729 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rin3P59729 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rin3P59729 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rin3P59729 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rin3P59729 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rin3P59729 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rin3P59729 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rin3P59729 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rin3P59729 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rin3P59729 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rin3P59729 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rin3P59729 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rin3P59729 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rin3P59729 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rin3P59729 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rin3P59729 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rin3P59729 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rin3P59729 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rin3P59729 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms