Protein–RNA interactions for Protein: P59114

Pcif1, Phosphorylated CTD-interacting factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 706 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcif1P59114 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Pcif1P59114 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Pcif1P59114 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Pcif1P59114 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Pcif1P59114 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Pcif1P59114 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Pcif1P59114 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pcif1P59114 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pcif1P59114 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pcif1P59114 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pcif1P59114 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pcif1P59114 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pcif1P59114 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pcif1P59114 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pcif1P59114 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pcif1P59114 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pcif1P59114 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Pcif1P59114 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Pcif1P59114 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Pcif1P59114 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Pcif1P59114 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Pcif1P59114 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Pcif1P59114 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Pcif1P59114 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Pcif1P59114 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pcif1P59114 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Pcif1P59114 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Pcif1P59114 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Pcif1P59114 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Pcif1P59114 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pcif1P59114 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Pcif1P59114 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Pcif1P59114 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Pcif1P59114 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Pcif1P59114 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Pcif1P59114 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Pcif1P59114 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Pcif1P59114 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Pcif1P59114 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pcif1P59114 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Pcif1P59114 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pcif1P59114 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pcif1P59114 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pcif1P59114 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Pcif1P59114 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Pcif1P59114 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Pcif1P59114 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Pcif1P59114 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Pcif1P59114 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Pcif1P59114 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Pcif1P59114 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pcif1P59114 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pcif1P59114 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pcif1P59114 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Pcif1P59114 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Pcif1P59114 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Pcif1P59114 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Pcif1P59114 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Pcif1P59114 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Pcif1P59114 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Pcif1P59114 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Pcif1P59114 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Pcif1P59114 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Pcif1P59114 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Pcif1P59114 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Pcif1P59114 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Pcif1P59114 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pcif1P59114 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Pcif1P59114 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pcif1P59114 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pcif1P59114 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Pcif1P59114 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Pcif1P59114 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Pcif1P59114 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Pcif1P59114 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Pcif1P59114 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Pcif1P59114 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Pcif1P59114 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Pcif1P59114 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Pcif1P59114 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pcif1P59114 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pcif1P59114 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Pcif1P59114 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Pcif1P59114 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Pcif1P59114 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Pcif1P59114 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Pcif1P59114 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Pcif1P59114 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pcif1P59114 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Pcif1P59114 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pcif1P59114 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pcif1P59114 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pcif1P59114 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pcif1P59114 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pcif1P59114 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Pcif1P59114 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Pcif1P59114 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Pcif1P59114 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Pcif1P59114 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Pcif1P59114 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.5 ms