Protein–RNA interactions for Protein: P56656

Cyp2c39, Cytochrome P450 2C39, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp2c39P56656 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cyp2c39P56656 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cyp2c39P56656 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cyp2c39P56656 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Cyp2c39P56656 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cyp2c39P56656 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Cyp2c39P56656 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Cyp2c39P56656 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cyp2c39P56656 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cyp2c39P56656 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cyp2c39P56656 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cyp2c39P56656 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cyp2c39P56656 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cyp2c39P56656 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cyp2c39P56656 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cyp2c39P56656 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cyp2c39P56656 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cyp2c39P56656 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cyp2c39P56656 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cyp2c39P56656 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cyp2c39P56656 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cyp2c39P56656 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cyp2c39P56656 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cyp2c39P56656 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cyp2c39P56656 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cyp2c39P56656 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Cyp2c39P56656 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cyp2c39P56656 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cyp2c39P56656 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cyp2c39P56656 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cyp2c39P56656 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cyp2c39P56656 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cyp2c39P56656 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cyp2c39P56656 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cyp2c39P56656 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cyp2c39P56656 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cyp2c39P56656 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Cyp2c39P56656 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cyp2c39P56656 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cyp2c39P56656 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cyp2c39P56656 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cyp2c39P56656 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cyp2c39P56656 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cyp2c39P56656 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cyp2c39P56656 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cyp2c39P56656 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cyp2c39P56656 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cyp2c39P56656 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Cyp2c39P56656 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Cyp2c39P56656 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cyp2c39P56656 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cyp2c39P56656 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cyp2c39P56656 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cyp2c39P56656 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cyp2c39P56656 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cyp2c39P56656 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cyp2c39P56656 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cyp2c39P56656 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cyp2c39P56656 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cyp2c39P56656 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cyp2c39P56656 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cyp2c39P56656 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cyp2c39P56656 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cyp2c39P56656 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cyp2c39P56656 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Cyp2c39P56656 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cyp2c39P56656 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cyp2c39P56656 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cyp2c39P56656 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cyp2c39P56656 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cyp2c39P56656 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cyp2c39P56656 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Cyp2c39P56656 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cyp2c39P56656 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cyp2c39P56656 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cyp2c39P56656 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cyp2c39P56656 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cyp2c39P56656 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cyp2c39P56656 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cyp2c39P56656 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cyp2c39P56656 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cyp2c39P56656 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cyp2c39P56656 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cyp2c39P56656 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cyp2c39P56656 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cyp2c39P56656 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cyp2c39P56656 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Cyp2c39P56656 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cyp2c39P56656 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cyp2c39P56656 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cyp2c39P56656 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Cyp2c39P56656 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Cyp2c39P56656 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Cyp2c39P56656 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cyp2c39P56656 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cyp2c39P56656 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cyp2c39P56656 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cyp2c39P56656 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cyp2c39P56656 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cyp2c39P56656 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms