Protein–RNA interactions for Protein: P56477

Irf5, Interferon regulatory factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf5P56477 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Irf5P56477 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Irf5P56477 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Irf5P56477 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Irf5P56477 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Irf5P56477 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Irf5P56477 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Irf5P56477 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Irf5P56477 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Irf5P56477 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Irf5P56477 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Irf5P56477 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Irf5P56477 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Irf5P56477 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Irf5P56477 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Irf5P56477 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Irf5P56477 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Irf5P56477 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Irf5P56477 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Irf5P56477 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Irf5P56477 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Irf5P56477 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Irf5P56477 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Irf5P56477 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Irf5P56477 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Irf5P56477 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Irf5P56477 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Irf5P56477 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Irf5P56477 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Irf5P56477 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Irf5P56477 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Irf5P56477 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Irf5P56477 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Irf5P56477 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Irf5P56477 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Irf5P56477 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Irf5P56477 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Irf5P56477 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Irf5P56477 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
Irf5P56477 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Irf5P56477 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Irf5P56477 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Irf5P56477 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Irf5P56477 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Irf5P56477 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Irf5P56477 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Irf5P56477 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Irf5P56477 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Irf5P56477 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Irf5P56477 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Irf5P56477 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Irf5P56477 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Irf5P56477 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Irf5P56477 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Irf5P56477 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Irf5P56477 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Irf5P56477 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Irf5P56477 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Irf5P56477 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Irf5P56477 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Irf5P56477 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Irf5P56477 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Irf5P56477 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Irf5P56477 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Irf5P56477 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Irf5P56477 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Irf5P56477 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Irf5P56477 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Irf5P56477 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Irf5P56477 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Irf5P56477 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Irf5P56477 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Irf5P56477 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Irf5P56477 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Irf5P56477 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Irf5P56477 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Irf5P56477 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Irf5P56477 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Irf5P56477 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Irf5P56477 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Irf5P56477 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Irf5P56477 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Irf5P56477 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Irf5P56477 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Irf5P56477 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Irf5P56477 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Irf5P56477 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Irf5P56477 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Irf5P56477 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Irf5P56477 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Irf5P56477 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Irf5P56477 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Irf5P56477 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Irf5P56477 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Irf5P56477 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Irf5P56477 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Irf5P56477 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Irf5P56477 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Irf5P56477 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Irf5P56477 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms