Protein–RNA interactions for Protein: P56388

Cartpt, Cocaine- and amphetamine-regulated transcript protein, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CartptP56388 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CartptP56388 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CartptP56388 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CartptP56388 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CartptP56388 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CartptP56388 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CartptP56388 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CartptP56388 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CartptP56388 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CartptP56388 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CartptP56388 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CartptP56388 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CartptP56388 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CartptP56388 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CartptP56388 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CartptP56388 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CartptP56388 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CartptP56388 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CartptP56388 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CartptP56388 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CartptP56388 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CartptP56388 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CartptP56388 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CartptP56388 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CartptP56388 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CartptP56388 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CartptP56388 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CartptP56388 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CartptP56388 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CartptP56388 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CartptP56388 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CartptP56388 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CartptP56388 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CartptP56388 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CartptP56388 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CartptP56388 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CartptP56388 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CartptP56388 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CartptP56388 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CartptP56388 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CartptP56388 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CartptP56388 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CartptP56388 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CartptP56388 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CartptP56388 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CartptP56388 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CartptP56388 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CartptP56388 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CartptP56388 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CartptP56388 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CartptP56388 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CartptP56388 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CartptP56388 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CartptP56388 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CartptP56388 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CartptP56388 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CartptP56388 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CartptP56388 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CartptP56388 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CartptP56388 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CartptP56388 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CartptP56388 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CartptP56388 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CartptP56388 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CartptP56388 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CartptP56388 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CartptP56388 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
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CartptP56388 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CartptP56388 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CartptP56388 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CartptP56388 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CartptP56388 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CartptP56388 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CartptP56388 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CartptP56388 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CartptP56388 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CartptP56388 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CartptP56388 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CartptP56388 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CartptP56388 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CartptP56388 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CartptP56388 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CartptP56388 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CartptP56388 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CartptP56388 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CartptP56388 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CartptP56388 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CartptP56388 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CartptP56388 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CartptP56388 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CartptP56388 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
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CartptP56388 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CartptP56388 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CartptP56388 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CartptP56388 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CartptP56388 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CartptP56388 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CartptP56388 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.1 ms