Protein–RNA interactions for Protein: P54754

Ephb3, Ephrin type-B receptor 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ephb3P54754 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ephb3P54754 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Ephb3P54754 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Ephb3P54754 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ephb3P54754 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ephb3P54754 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ephb3P54754 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ephb3P54754 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ephb3P54754 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ephb3P54754 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ephb3P54754 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ephb3P54754 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ephb3P54754 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ephb3P54754 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Ephb3P54754 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ephb3P54754 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ephb3P54754 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ephb3P54754 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Ephb3P54754 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ephb3P54754 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ephb3P54754 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ephb3P54754 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ephb3P54754 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ephb3P54754 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ephb3P54754 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ephb3P54754 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ephb3P54754 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ephb3P54754 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ephb3P54754 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ephb3P54754 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Ephb3P54754 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ephb3P54754 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ephb3P54754 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ephb3P54754 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ephb3P54754 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ephb3P54754 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ephb3P54754 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ephb3P54754 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ephb3P54754 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ephb3P54754 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ephb3P54754 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ephb3P54754 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ephb3P54754 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ephb3P54754 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ephb3P54754 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ephb3P54754 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ephb3P54754 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ephb3P54754 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ephb3P54754 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ephb3P54754 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ephb3P54754 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ephb3P54754 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ephb3P54754 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ephb3P54754 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Ephb3P54754 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ephb3P54754 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ephb3P54754 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ephb3P54754 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ephb3P54754 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ephb3P54754 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ephb3P54754 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ephb3P54754 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ephb3P54754 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ephb3P54754 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ephb3P54754 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ephb3P54754 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ephb3P54754 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ephb3P54754 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ephb3P54754 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ephb3P54754 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ephb3P54754 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ephb3P54754 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ephb3P54754 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ephb3P54754 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ephb3P54754 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ephb3P54754 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ephb3P54754 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ephb3P54754 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ephb3P54754 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Ephb3P54754 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ephb3P54754 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ephb3P54754 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ephb3P54754 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ephb3P54754 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ephb3P54754 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ephb3P54754 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ephb3P54754 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ephb3P54754 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ephb3P54754 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ephb3P54754 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ephb3P54754 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ephb3P54754 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ephb3P54754 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ephb3P54754 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ephb3P54754 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ephb3P54754 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ephb3P54754 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ephb3P54754 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ephb3P54754 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ephb3P54754 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms