Protein–RNA interactions for Protein: P54731

Faf1, FAS-associated factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Faf1P54731 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Faf1P54731 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Faf1P54731 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Faf1P54731 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Faf1P54731 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Faf1P54731 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Faf1P54731 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Faf1P54731 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Faf1P54731 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Faf1P54731 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Faf1P54731 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Faf1P54731 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Faf1P54731 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Faf1P54731 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Faf1P54731 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Faf1P54731 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Faf1P54731 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Faf1P54731 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Faf1P54731 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Faf1P54731 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Faf1P54731 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Faf1P54731 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Faf1P54731 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Faf1P54731 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Faf1P54731 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Faf1P54731 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Faf1P54731 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Faf1P54731 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Faf1P54731 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Faf1P54731 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Faf1P54731 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Faf1P54731 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Faf1P54731 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Faf1P54731 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Faf1P54731 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Faf1P54731 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Faf1P54731 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Faf1P54731 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Faf1P54731 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Faf1P54731 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Faf1P54731 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Faf1P54731 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Faf1P54731 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Faf1P54731 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Faf1P54731 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Faf1P54731 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Faf1P54731 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Faf1P54731 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Faf1P54731 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Faf1P54731 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Faf1P54731 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Faf1P54731 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Faf1P54731 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Faf1P54731 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Faf1P54731 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Faf1P54731 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Faf1P54731 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Faf1P54731 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Faf1P54731 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Faf1P54731 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Faf1P54731 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Faf1P54731 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Faf1P54731 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Faf1P54731 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Faf1P54731 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Faf1P54731 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Faf1P54731 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Faf1P54731 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Faf1P54731 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Faf1P54731 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Faf1P54731 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Faf1P54731 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.27■■□□□ 1
Faf1P54731 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Faf1P54731 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Faf1P54731 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Faf1P54731 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Faf1P54731 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Faf1P54731 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Faf1P54731 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Faf1P54731 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Faf1P54731 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Faf1P54731 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Faf1P54731 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Faf1P54731 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Faf1P54731 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Faf1P54731 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Faf1P54731 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Faf1P54731 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Faf1P54731 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Faf1P54731 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Faf1P54731 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Faf1P54731 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Faf1P54731 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Faf1P54731 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Faf1P54731 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Faf1P54731 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Faf1P54731 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Faf1P54731 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Faf1P54731 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Faf1P54731 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78 ms