Protein–RNA interactions for Protein: P50608

Fmod, Fibromodulin, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FmodP50608 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FmodP50608 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FmodP50608 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FmodP50608 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FmodP50608 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FmodP50608 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FmodP50608 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FmodP50608 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FmodP50608 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FmodP50608 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FmodP50608 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FmodP50608 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FmodP50608 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FmodP50608 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FmodP50608 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FmodP50608 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FmodP50608 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FmodP50608 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FmodP50608 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
FmodP50608 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
FmodP50608 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FmodP50608 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FmodP50608 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FmodP50608 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FmodP50608 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FmodP50608 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FmodP50608 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC18■□□□□ 0.47
FmodP50608 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
FmodP50608 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FmodP50608 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
FmodP50608 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FmodP50608 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FmodP50608 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FmodP50608 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
FmodP50608 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FmodP50608 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FmodP50608 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FmodP50608 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FmodP50608 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FmodP50608 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FmodP50608 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FmodP50608 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FmodP50608 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FmodP50608 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FmodP50608 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FmodP50608 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
FmodP50608 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
FmodP50608 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FmodP50608 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
FmodP50608 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FmodP50608 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FmodP50608 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
FmodP50608 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FmodP50608 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FmodP50608 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FmodP50608 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
FmodP50608 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
FmodP50608 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FmodP50608 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
FmodP50608 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FmodP50608 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FmodP50608 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FmodP50608 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FmodP50608 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FmodP50608 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FmodP50608 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FmodP50608 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FmodP50608 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FmodP50608 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FmodP50608 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FmodP50608 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
FmodP50608 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
FmodP50608 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
FmodP50608 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
FmodP50608 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
FmodP50608 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
FmodP50608 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
FmodP50608 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
FmodP50608 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
FmodP50608 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
FmodP50608 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FmodP50608 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FmodP50608 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
FmodP50608 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
FmodP50608 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
FmodP50608 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
FmodP50608 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FmodP50608 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FmodP50608 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
FmodP50608 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FmodP50608 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
FmodP50608 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FmodP50608 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FmodP50608 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FmodP50608 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FmodP50608 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
FmodP50608 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FmodP50608 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FmodP50608 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FmodP50608 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms