Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PtpreP49446 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PtpreP49446 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PtpreP49446 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PtpreP49446 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PtpreP49446 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PtpreP49446 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PtpreP49446 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PtpreP49446 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PtpreP49446 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PtpreP49446 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PtpreP49446 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PtpreP49446 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PtpreP49446 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
PtpreP49446 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PtpreP49446 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
PtpreP49446 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PtpreP49446 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PtpreP49446 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PtpreP49446 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PtpreP49446 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PtpreP49446 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PtpreP49446 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PtpreP49446 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PtpreP49446 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PtpreP49446 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PtpreP49446 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PtpreP49446 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PtpreP49446 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PtpreP49446 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PtpreP49446 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PtpreP49446 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PtpreP49446 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PtpreP49446 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PtpreP49446 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PtpreP49446 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PtpreP49446 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PtpreP49446 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PtpreP49446 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PtpreP49446 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PtpreP49446 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PtpreP49446 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PtpreP49446 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PtpreP49446 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PtpreP49446 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PtpreP49446 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PtpreP49446 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PtpreP49446 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PtpreP49446 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
PtpreP49446 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PtpreP49446 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PtpreP49446 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PtpreP49446 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PtpreP49446 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PtpreP49446 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
PtpreP49446 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PtpreP49446 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PtpreP49446 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PtpreP49446 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PtpreP49446 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PtpreP49446 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PtpreP49446 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PtpreP49446 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PtpreP49446 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PtpreP49446 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PtpreP49446 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PtpreP49446 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PtpreP49446 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
PtpreP49446 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PtpreP49446 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PtpreP49446 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PtpreP49446 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PtpreP49446 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PtpreP49446 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PtpreP49446 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PtpreP49446 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PtpreP49446 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PtpreP49446 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PtpreP49446 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PtpreP49446 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PtpreP49446 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PtpreP49446 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PtpreP49446 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PtpreP49446 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PtpreP49446 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PtpreP49446 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PtpreP49446 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PtpreP49446 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PtpreP49446 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PtpreP49446 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PtpreP49446 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PtpreP49446 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PtpreP49446 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PtpreP49446 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PtpreP49446 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PtpreP49446 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PtpreP49446 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PtpreP49446 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PtpreP49446 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PtpreP49446 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
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