Protein–RNA interactions for Protein: P48299

Edn3, Endothelin-3, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edn3P48299 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Edn3P48299 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Edn3P48299 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Edn3P48299 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Edn3P48299 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Edn3P48299 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Edn3P48299 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Edn3P48299 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Edn3P48299 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Edn3P48299 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Edn3P48299 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Edn3P48299 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Edn3P48299 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Edn3P48299 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Edn3P48299 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Edn3P48299 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Edn3P48299 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Edn3P48299 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Edn3P48299 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Edn3P48299 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Edn3P48299 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Edn3P48299 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Edn3P48299 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Edn3P48299 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Edn3P48299 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Edn3P48299 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Edn3P48299 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Edn3P48299 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Edn3P48299 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Edn3P48299 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Edn3P48299 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Edn3P48299 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Edn3P48299 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Edn3P48299 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Edn3P48299 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Edn3P48299 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Edn3P48299 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Edn3P48299 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Edn3P48299 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Edn3P48299 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Edn3P48299 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Edn3P48299 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Edn3P48299 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Edn3P48299 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Edn3P48299 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Edn3P48299 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Edn3P48299 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Edn3P48299 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Edn3P48299 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Edn3P48299 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Edn3P48299 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Edn3P48299 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Edn3P48299 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Edn3P48299 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Edn3P48299 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Edn3P48299 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Edn3P48299 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Edn3P48299 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Edn3P48299 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Edn3P48299 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Edn3P48299 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Edn3P48299 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Edn3P48299 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Edn3P48299 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Edn3P48299 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Edn3P48299 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Edn3P48299 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Edn3P48299 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Edn3P48299 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Edn3P48299 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Edn3P48299 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Edn3P48299 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Edn3P48299 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Edn3P48299 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Edn3P48299 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Edn3P48299 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Edn3P48299 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Edn3P48299 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Edn3P48299 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Edn3P48299 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Edn3P48299 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Edn3P48299 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Edn3P48299 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Edn3P48299 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Edn3P48299 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Edn3P48299 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Edn3P48299 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Edn3P48299 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Edn3P48299 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Edn3P48299 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Edn3P48299 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Edn3P48299 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Edn3P48299 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Edn3P48299 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Edn3P48299 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Edn3P48299 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Edn3P48299 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Edn3P48299 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Edn3P48299 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Edn3P48299 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms