Protein–RNA interactions for Protein: P47939

Resp18, Regulated endocrine-specific protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Resp18P47939 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Resp18P47939 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Resp18P47939 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Resp18P47939 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Resp18P47939 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Resp18P47939 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Resp18P47939 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Resp18P47939 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Resp18P47939 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Resp18P47939 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Resp18P47939 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Resp18P47939 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Resp18P47939 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Resp18P47939 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Resp18P47939 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Resp18P47939 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Resp18P47939 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Resp18P47939 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Resp18P47939 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Resp18P47939 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Resp18P47939 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Resp18P47939 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Resp18P47939 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Resp18P47939 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Resp18P47939 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Resp18P47939 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Resp18P47939 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Resp18P47939 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Resp18P47939 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Resp18P47939 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Resp18P47939 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Resp18P47939 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Resp18P47939 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Resp18P47939 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Resp18P47939 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Resp18P47939 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Resp18P47939 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Resp18P47939 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Resp18P47939 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Resp18P47939 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Resp18P47939 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Resp18P47939 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Resp18P47939 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Resp18P47939 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Resp18P47939 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Resp18P47939 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Resp18P47939 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Resp18P47939 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Resp18P47939 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Resp18P47939 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Resp18P47939 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Resp18P47939 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Resp18P47939 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Resp18P47939 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Resp18P47939 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Resp18P47939 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Resp18P47939 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Resp18P47939 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Resp18P47939 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Resp18P47939 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Resp18P47939 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Resp18P47939 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Resp18P47939 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Resp18P47939 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Resp18P47939 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Resp18P47939 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Resp18P47939 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Resp18P47939 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Resp18P47939 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Resp18P47939 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Resp18P47939 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Resp18P47939 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Resp18P47939 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Resp18P47939 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Resp18P47939 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Resp18P47939 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Resp18P47939 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Resp18P47939 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Resp18P47939 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Resp18P47939 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Resp18P47939 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Resp18P47939 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Resp18P47939 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Resp18P47939 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Resp18P47939 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Resp18P47939 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Resp18P47939 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Resp18P47939 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Resp18P47939 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Resp18P47939 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Resp18P47939 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Resp18P47939 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Resp18P47939 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Resp18P47939 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Resp18P47939 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Resp18P47939 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Resp18P47939 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Resp18P47939 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Resp18P47939 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Resp18P47939 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms