Protein–RNA interactions for Protein: P46062

Sipa1, Signal-induced proliferation-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,037 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sipa1P46062 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Sipa1P46062 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sipa1P46062 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sipa1P46062 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sipa1P46062 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sipa1P46062 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Sipa1P46062 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Sipa1P46062 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Sipa1P46062 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Sipa1P46062 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sipa1P46062 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sipa1P46062 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sipa1P46062 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sipa1P46062 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sipa1P46062 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sipa1P46062 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sipa1P46062 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sipa1P46062 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sipa1P46062 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sipa1P46062 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sipa1P46062 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sipa1P46062 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sipa1P46062 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sipa1P46062 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sipa1P46062 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sipa1P46062 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sipa1P46062 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sipa1P46062 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sipa1P46062 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sipa1P46062 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sipa1P46062 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sipa1P46062 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sipa1P46062 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sipa1P46062 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Sipa1P46062 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sipa1P46062 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sipa1P46062 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sipa1P46062 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sipa1P46062 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sipa1P46062 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sipa1P46062 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sipa1P46062 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sipa1P46062 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sipa1P46062 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sipa1P46062 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sipa1P46062 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sipa1P46062 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sipa1P46062 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sipa1P46062 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sipa1P46062 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sipa1P46062 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sipa1P46062 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sipa1P46062 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sipa1P46062 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sipa1P46062 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sipa1P46062 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sipa1P46062 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sipa1P46062 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sipa1P46062 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sipa1P46062 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sipa1P46062 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sipa1P46062 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sipa1P46062 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sipa1P46062 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sipa1P46062 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sipa1P46062 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sipa1P46062 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sipa1P46062 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sipa1P46062 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sipa1P46062 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sipa1P46062 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Sipa1P46062 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sipa1P46062 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sipa1P46062 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sipa1P46062 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sipa1P46062 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sipa1P46062 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sipa1P46062 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sipa1P46062 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Sipa1P46062 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sipa1P46062 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sipa1P46062 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sipa1P46062 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sipa1P46062 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sipa1P46062 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sipa1P46062 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sipa1P46062 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sipa1P46062 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sipa1P46062 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sipa1P46062 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sipa1P46062 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sipa1P46062 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sipa1P46062 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sipa1P46062 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sipa1P46062 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Sipa1P46062 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Sipa1P46062 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sipa1P46062 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sipa1P46062 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sipa1P46062 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12 ms