Protein–RNA interactions for Protein: P43027

Gdf5, Growth/differentiation factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf5P43027 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gdf5P43027 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gdf5P43027 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gdf5P43027 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gdf5P43027 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Gdf5P43027 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gdf5P43027 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gdf5P43027 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Gdf5P43027 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Gdf5P43027 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Gdf5P43027 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gdf5P43027 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gdf5P43027 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gdf5P43027 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gdf5P43027 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gdf5P43027 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gdf5P43027 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gdf5P43027 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gdf5P43027 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gdf5P43027 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gdf5P43027 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gdf5P43027 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gdf5P43027 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gdf5P43027 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gdf5P43027 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gdf5P43027 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gdf5P43027 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gdf5P43027 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Gdf5P43027 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Gdf5P43027 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gdf5P43027 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gdf5P43027 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gdf5P43027 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gdf5P43027 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gdf5P43027 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gdf5P43027 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gdf5P43027 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gdf5P43027 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gdf5P43027 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gdf5P43027 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gdf5P43027 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gdf5P43027 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gdf5P43027 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gdf5P43027 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gdf5P43027 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gdf5P43027 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gdf5P43027 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gdf5P43027 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Gdf5P43027 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gdf5P43027 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Gdf5P43027 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gdf5P43027 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gdf5P43027 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gdf5P43027 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gdf5P43027 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gdf5P43027 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Gdf5P43027 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gdf5P43027 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gdf5P43027 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gdf5P43027 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gdf5P43027 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gdf5P43027 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gdf5P43027 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gdf5P43027 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gdf5P43027 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gdf5P43027 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gdf5P43027 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gdf5P43027 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gdf5P43027 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gdf5P43027 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gdf5P43027 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gdf5P43027 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gdf5P43027 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gdf5P43027 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gdf5P43027 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gdf5P43027 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gdf5P43027 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gdf5P43027 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gdf5P43027 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gdf5P43027 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gdf5P43027 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gdf5P43027 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Gdf5P43027 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gdf5P43027 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gdf5P43027 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gdf5P43027 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gdf5P43027 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gdf5P43027 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gdf5P43027 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gdf5P43027 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gdf5P43027 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gdf5P43027 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Gdf5P43027 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gdf5P43027 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gdf5P43027 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gdf5P43027 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gdf5P43027 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gdf5P43027 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gdf5P43027 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gdf5P43027 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.3 ms