Protein–RNA interactions for Protein: P40142

Tkt, Transketolase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TktP40142 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TktP40142 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TktP40142 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TktP40142 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TktP40142 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TktP40142 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TktP40142 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TktP40142 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TktP40142 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TktP40142 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TktP40142 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
TktP40142 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TktP40142 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TktP40142 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TktP40142 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TktP40142 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TktP40142 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TktP40142 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TktP40142 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TktP40142 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
TktP40142 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TktP40142 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TktP40142 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TktP40142 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TktP40142 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TktP40142 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TktP40142 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TktP40142 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TktP40142 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TktP40142 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TktP40142 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TktP40142 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TktP40142 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TktP40142 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TktP40142 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TktP40142 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TktP40142 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TktP40142 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TktP40142 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TktP40142 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TktP40142 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TktP40142 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TktP40142 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TktP40142 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TktP40142 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TktP40142 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TktP40142 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TktP40142 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TktP40142 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TktP40142 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TktP40142 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TktP40142 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TktP40142 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TktP40142 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TktP40142 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TktP40142 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TktP40142 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TktP40142 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TktP40142 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TktP40142 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TktP40142 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TktP40142 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TktP40142 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TktP40142 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TktP40142 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TktP40142 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TktP40142 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TktP40142 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TktP40142 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TktP40142 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TktP40142 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TktP40142 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TktP40142 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TktP40142 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TktP40142 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TktP40142 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TktP40142 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TktP40142 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TktP40142 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TktP40142 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TktP40142 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TktP40142 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TktP40142 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TktP40142 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TktP40142 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TktP40142 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TktP40142 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TktP40142 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TktP40142 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TktP40142 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TktP40142 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TktP40142 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TktP40142 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TktP40142 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TktP40142 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TktP40142 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TktP40142 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TktP40142 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TktP40142 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TktP40142 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms