Protein–RNA interactions for Protein: P37913

Lig1, DNA ligase 1, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig1P37913 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Lig1P37913 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Lig1P37913 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Lig1P37913 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Lig1P37913 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Lig1P37913 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Lig1P37913 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Lig1P37913 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Lig1P37913 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Lig1P37913 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Lig1P37913 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Lig1P37913 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Lig1P37913 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Lig1P37913 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Lig1P37913 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Lig1P37913 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Lig1P37913 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Lig1P37913 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Lig1P37913 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Lig1P37913 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Lig1P37913 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Lig1P37913 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Lig1P37913 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Lig1P37913 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Lig1P37913 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Lig1P37913 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Lig1P37913 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Lig1P37913 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Lig1P37913 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Lig1P37913 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Lig1P37913 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Lig1P37913 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Lig1P37913 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Lig1P37913 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Lig1P37913 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Lig1P37913 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Lig1P37913 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Lig1P37913 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Lig1P37913 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Lig1P37913 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Lig1P37913 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Lig1P37913 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Lig1P37913 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Lig1P37913 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Lig1P37913 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Lig1P37913 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Lig1P37913 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Lig1P37913 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Lig1P37913 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Lig1P37913 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Lig1P37913 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Lig1P37913 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Lig1P37913 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Lig1P37913 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Lig1P37913 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Lig1P37913 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Lig1P37913 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Lig1P37913 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Lig1P37913 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Lig1P37913 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Lig1P37913 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Lig1P37913 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Lig1P37913 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Lig1P37913 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Lig1P37913 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Lig1P37913 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Lig1P37913 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Lig1P37913 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Lig1P37913 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Lig1P37913 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Lig1P37913 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Lig1P37913 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Lig1P37913 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Lig1P37913 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Lig1P37913 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Lig1P37913 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Lig1P37913 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Lig1P37913 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Lig1P37913 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Lig1P37913 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Lig1P37913 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Lig1P37913 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Lig1P37913 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Lig1P37913 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Lig1P37913 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Lig1P37913 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Lig1P37913 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Lig1P37913 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Lig1P37913 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Lig1P37913 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Lig1P37913 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Lig1P37913 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Lig1P37913 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Lig1P37913 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Lig1P37913 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Lig1P37913 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Lig1P37913 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Lig1P37913 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Lig1P37913 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Lig1P37913 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms