Protein–RNA interactions for Protein: P35438

Grin1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, mousemouse

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin1P35438 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Grin1P35438 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Grin1P35438 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Grin1P35438 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Grin1P35438 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Grin1P35438 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Grin1P35438 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Grin1P35438 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Grin1P35438 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Grin1P35438 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Grin1P35438 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Grin1P35438 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Grin1P35438 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Grin1P35438 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Grin1P35438 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Grin1P35438 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Grin1P35438 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Grin1P35438 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Grin1P35438 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Grin1P35438 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Grin1P35438 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Grin1P35438 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Grin1P35438 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Grin1P35438 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Grin1P35438 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Grin1P35438 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Grin1P35438 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Grin1P35438 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Grin1P35438 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Grin1P35438 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Grin1P35438 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Grin1P35438 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Grin1P35438 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Grin1P35438 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Grin1P35438 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Grin1P35438 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Grin1P35438 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Grin1P35438 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Grin1P35438 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Grin1P35438 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Grin1P35438 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Grin1P35438 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Grin1P35438 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Grin1P35438 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Grin1P35438 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Grin1P35438 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Grin1P35438 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Grin1P35438 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Grin1P35438 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Grin1P35438 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Grin1P35438 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Grin1P35438 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Grin1P35438 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Grin1P35438 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Grin1P35438 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Grin1P35438 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Grin1P35438 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Grin1P35438 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Grin1P35438 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Grin1P35438 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Grin1P35438 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Grin1P35438 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Grin1P35438 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Grin1P35438 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Grin1P35438 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Grin1P35438 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Grin1P35438 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Grin1P35438 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Grin1P35438 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Grin1P35438 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Grin1P35438 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Grin1P35438 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Grin1P35438 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Grin1P35438 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Grin1P35438 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Grin1P35438 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Grin1P35438 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Grin1P35438 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Grin1P35438 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Grin1P35438 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Grin1P35438 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Grin1P35438 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Grin1P35438 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Grin1P35438 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Grin1P35438 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Grin1P35438 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Grin1P35438 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Grin1P35438 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Grin1P35438 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Grin1P35438 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Grin1P35438 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Grin1P35438 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Grin1P35438 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Grin1P35438 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Grin1P35438 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Grin1P35438 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Grin1P35438 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Grin1P35438 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Grin1P35438 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Grin1P35438 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 102.7 ms