Protein–RNA interactions for Protein: P35288

Rab23, Ras-related protein Rab-23, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab23P35288 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rab23P35288 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rab23P35288 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rab23P35288 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rab23P35288 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rab23P35288 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rab23P35288 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Rab23P35288 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rab23P35288 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rab23P35288 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rab23P35288 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rab23P35288 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rab23P35288 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rab23P35288 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rab23P35288 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rab23P35288 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rab23P35288 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rab23P35288 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rab23P35288 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rab23P35288 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rab23P35288 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Rab23P35288 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rab23P35288 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rab23P35288 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rab23P35288 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rab23P35288 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rab23P35288 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rab23P35288 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rab23P35288 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rab23P35288 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rab23P35288 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rab23P35288 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rab23P35288 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rab23P35288 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rab23P35288 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rab23P35288 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rab23P35288 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rab23P35288 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rab23P35288 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rab23P35288 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rab23P35288 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rab23P35288 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rab23P35288 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rab23P35288 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rab23P35288 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rab23P35288 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rab23P35288 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rab23P35288 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rab23P35288 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rab23P35288 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rab23P35288 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rab23P35288 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rab23P35288 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rab23P35288 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rab23P35288 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rab23P35288 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rab23P35288 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rab23P35288 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rab23P35288 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rab23P35288 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rab23P35288 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rab23P35288 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rab23P35288 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rab23P35288 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rab23P35288 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rab23P35288 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Rab23P35288 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rab23P35288 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rab23P35288 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rab23P35288 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rab23P35288 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rab23P35288 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rab23P35288 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rab23P35288 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rab23P35288 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rab23P35288 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rab23P35288 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rab23P35288 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rab23P35288 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rab23P35288 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rab23P35288 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rab23P35288 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rab23P35288 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Rab23P35288 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rab23P35288 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rab23P35288 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rab23P35288 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rab23P35288 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rab23P35288 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Rab23P35288 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rab23P35288 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rab23P35288 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rab23P35288 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rab23P35288 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rab23P35288 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rab23P35288 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rab23P35288 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rab23P35288 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rab23P35288 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rab23P35288 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms