Protein–RNA interactions for Protein: P35235

Ptpn11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, mousemouse

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn11P35235 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ptpn11P35235 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ptpn11P35235 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ptpn11P35235 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ptpn11P35235 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ptpn11P35235 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ptpn11P35235 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ptpn11P35235 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ptpn11P35235 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ptpn11P35235 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ptpn11P35235 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ptpn11P35235 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ptpn11P35235 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ptpn11P35235 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ptpn11P35235 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ptpn11P35235 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ptpn11P35235 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ptpn11P35235 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ptpn11P35235 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ptpn11P35235 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ptpn11P35235 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ptpn11P35235 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Ptpn11P35235 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
Ptpn11P35235 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ptpn11P35235 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ptpn11P35235 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ptpn11P35235 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Ptpn11P35235 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ptpn11P35235 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ptpn11P35235 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ptpn11P35235 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ptpn11P35235 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ptpn11P35235 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ptpn11P35235 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ptpn11P35235 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ptpn11P35235 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Ptpn11P35235 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ptpn11P35235 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ptpn11P35235 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ptpn11P35235 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ptpn11P35235 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ptpn11P35235 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ptpn11P35235 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ptpn11P35235 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ptpn11P35235 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ptpn11P35235 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ptpn11P35235 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ptpn11P35235 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ptpn11P35235 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ptpn11P35235 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ptpn11P35235 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ptpn11P35235 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ptpn11P35235 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ptpn11P35235 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ptpn11P35235 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Ptpn11P35235 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ptpn11P35235 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ptpn11P35235 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ptpn11P35235 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ptpn11P35235 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ptpn11P35235 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ptpn11P35235 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ptpn11P35235 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ptpn11P35235 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ptpn11P35235 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ptpn11P35235 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ptpn11P35235 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ptpn11P35235 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ptpn11P35235 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ptpn11P35235 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ptpn11P35235 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ptpn11P35235 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ptpn11P35235 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ptpn11P35235 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ptpn11P35235 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ptpn11P35235 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ptpn11P35235 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ptpn11P35235 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ptpn11P35235 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ptpn11P35235 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ptpn11P35235 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ptpn11P35235 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ptpn11P35235 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ptpn11P35235 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ptpn11P35235 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ptpn11P35235 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Ptpn11P35235 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ptpn11P35235 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Ptpn11P35235 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ptpn11P35235 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ptpn11P35235 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ptpn11P35235 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ptpn11P35235 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ptpn11P35235 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ptpn11P35235 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ptpn11P35235 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ptpn11P35235 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ptpn11P35235 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ptpn11P35235 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ptpn11P35235 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms