Protein–RNA interactions for Protein: P34960

Mmp12, Macrophage metalloelastase, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp12P34960 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mmp12P34960 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mmp12P34960 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mmp12P34960 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Mmp12P34960 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Mmp12P34960 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Mmp12P34960 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Mmp12P34960 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Mmp12P34960 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Mmp12P34960 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Mmp12P34960 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Mmp12P34960 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Mmp12P34960 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Mmp12P34960 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Mmp12P34960 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Mmp12P34960 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Mmp12P34960 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Mmp12P34960 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Mmp12P34960 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Mmp12P34960 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Mmp12P34960 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Mmp12P34960 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Mmp12P34960 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Mmp12P34960 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Mmp12P34960 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Mmp12P34960 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Mmp12P34960 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Mmp12P34960 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Mmp12P34960 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Mmp12P34960 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Mmp12P34960 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Mmp12P34960 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Mmp12P34960 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Mmp12P34960 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Mmp12P34960 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Mmp12P34960 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Mmp12P34960 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Mmp12P34960 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Mmp12P34960 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Mmp12P34960 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Mmp12P34960 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Mmp12P34960 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Mmp12P34960 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Mmp12P34960 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Mmp12P34960 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Mmp12P34960 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Mmp12P34960 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Mmp12P34960 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Mmp12P34960 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Mmp12P34960 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Mmp12P34960 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Mmp12P34960 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Mmp12P34960 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Mmp12P34960 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Mmp12P34960 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Mmp12P34960 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Mmp12P34960 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Mmp12P34960 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Mmp12P34960 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Mmp12P34960 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Mmp12P34960 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Mmp12P34960 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Mmp12P34960 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Mmp12P34960 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Mmp12P34960 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Mmp12P34960 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Mmp12P34960 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Mmp12P34960 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Mmp12P34960 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Mmp12P34960 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Mmp12P34960 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Mmp12P34960 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Mmp12P34960 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Mmp12P34960 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Mmp12P34960 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Mmp12P34960 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Mmp12P34960 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Mmp12P34960 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Mmp12P34960 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Mmp12P34960 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Mmp12P34960 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Mmp12P34960 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Mmp12P34960 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Mmp12P34960 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Mmp12P34960 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Mmp12P34960 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Mmp12P34960 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Mmp12P34960 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Mmp12P34960 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Mmp12P34960 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Mmp12P34960 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Mmp12P34960 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Mmp12P34960 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Mmp12P34960 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Mmp12P34960 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Mmp12P34960 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Mmp12P34960 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Mmp12P34960 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Mmp12P34960 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Mmp12P34960 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.8 ms