Protein–RNA interactions for Protein: P34928

Apoc1, Apolipoprotein C-I, mousemouse

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc1P34928 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Apoc1P34928 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Apoc1P34928 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Apoc1P34928 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Apoc1P34928 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Apoc1P34928 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Apoc1P34928 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Apoc1P34928 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Apoc1P34928 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Apoc1P34928 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Apoc1P34928 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Apoc1P34928 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Apoc1P34928 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Apoc1P34928 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Apoc1P34928 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Apoc1P34928 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Apoc1P34928 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Apoc1P34928 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Apoc1P34928 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Apoc1P34928 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Apoc1P34928 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Apoc1P34928 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Apoc1P34928 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Apoc1P34928 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Apoc1P34928 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Apoc1P34928 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Apoc1P34928 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Apoc1P34928 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Apoc1P34928 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Apoc1P34928 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Apoc1P34928 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Apoc1P34928 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Apoc1P34928 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Apoc1P34928 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Apoc1P34928 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Apoc1P34928 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Apoc1P34928 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Apoc1P34928 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Apoc1P34928 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Apoc1P34928 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Apoc1P34928 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Apoc1P34928 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Apoc1P34928 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Apoc1P34928 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Apoc1P34928 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Apoc1P34928 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Apoc1P34928 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Apoc1P34928 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Apoc1P34928 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Apoc1P34928 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Apoc1P34928 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Apoc1P34928 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Apoc1P34928 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Apoc1P34928 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Apoc1P34928 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Apoc1P34928 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Apoc1P34928 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Apoc1P34928 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Apoc1P34928 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Apoc1P34928 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Apoc1P34928 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Apoc1P34928 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Apoc1P34928 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Apoc1P34928 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Apoc1P34928 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Apoc1P34928 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Apoc1P34928 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Apoc1P34928 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Apoc1P34928 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Apoc1P34928 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Apoc1P34928 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Apoc1P34928 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Apoc1P34928 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Apoc1P34928 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Apoc1P34928 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Apoc1P34928 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Apoc1P34928 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Apoc1P34928 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Apoc1P34928 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Apoc1P34928 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Apoc1P34928 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Apoc1P34928 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Apoc1P34928 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Apoc1P34928 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Apoc1P34928 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Apoc1P34928 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Apoc1P34928 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Apoc1P34928 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Apoc1P34928 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Apoc1P34928 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Apoc1P34928 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Apoc1P34928 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Apoc1P34928 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Apoc1P34928 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Apoc1P34928 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Apoc1P34928 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Apoc1P34928 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Apoc1P34928 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Apoc1P34928 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Apoc1P34928 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms