Protein–RNA interactions for Protein: P34152

Ptk2, Focal adhesion kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptk2P34152 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ptk2P34152 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ptk2P34152 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ptk2P34152 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ptk2P34152 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ptk2P34152 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ptk2P34152 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ptk2P34152 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ptk2P34152 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ptk2P34152 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Ptk2P34152 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ptk2P34152 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ptk2P34152 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ptk2P34152 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ptk2P34152 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ptk2P34152 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ptk2P34152 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ptk2P34152 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ptk2P34152 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ptk2P34152 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Ptk2P34152 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ptk2P34152 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ptk2P34152 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ptk2P34152 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ptk2P34152 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ptk2P34152 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ptk2P34152 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ptk2P34152 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ptk2P34152 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ptk2P34152 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ptk2P34152 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ptk2P34152 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ptk2P34152 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ptk2P34152 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ptk2P34152 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ptk2P34152 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ptk2P34152 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ptk2P34152 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ptk2P34152 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ptk2P34152 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ptk2P34152 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ptk2P34152 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ptk2P34152 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ptk2P34152 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ptk2P34152 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ptk2P34152 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ptk2P34152 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ptk2P34152 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ptk2P34152 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ptk2P34152 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ptk2P34152 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ptk2P34152 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Ptk2P34152 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Ptk2P34152 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ptk2P34152 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ptk2P34152 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ptk2P34152 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ptk2P34152 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ptk2P34152 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ptk2P34152 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ptk2P34152 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Ptk2P34152 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ptk2P34152 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ptk2P34152 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ptk2P34152 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ptk2P34152 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ptk2P34152 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ptk2P34152 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ptk2P34152 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ptk2P34152 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ptk2P34152 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ptk2P34152 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ptk2P34152 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ptk2P34152 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ptk2P34152 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ptk2P34152 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ptk2P34152 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ptk2P34152 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ptk2P34152 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ptk2P34152 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ptk2P34152 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ptk2P34152 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ptk2P34152 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ptk2P34152 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ptk2P34152 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Ptk2P34152 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ptk2P34152 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ptk2P34152 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ptk2P34152 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ptk2P34152 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ptk2P34152 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ptk2P34152 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Ptk2P34152 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ptk2P34152 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ptk2P34152 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ptk2P34152 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ptk2P34152 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ptk2P34152 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ptk2P34152 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ptk2P34152 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.7 ms