Protein–RNA interactions for Protein: P28705

Rxrg, Retinoic acid receptor RXR-gamma, mousemouse

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Length 463 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxrgP28705 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RxrgP28705 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RxrgP28705 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RxrgP28705 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
RxrgP28705 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RxrgP28705 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RxrgP28705 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RxrgP28705 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RxrgP28705 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
RxrgP28705 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
RxrgP28705 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RxrgP28705 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RxrgP28705 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RxrgP28705 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RxrgP28705 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RxrgP28705 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RxrgP28705 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RxrgP28705 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RxrgP28705 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RxrgP28705 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RxrgP28705 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RxrgP28705 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RxrgP28705 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
RxrgP28705 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RxrgP28705 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RxrgP28705 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RxrgP28705 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RxrgP28705 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RxrgP28705 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RxrgP28705 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RxrgP28705 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RxrgP28705 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RxrgP28705 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RxrgP28705 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RxrgP28705 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RxrgP28705 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RxrgP28705 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RxrgP28705 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RxrgP28705 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RxrgP28705 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RxrgP28705 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RxrgP28705 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RxrgP28705 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RxrgP28705 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RxrgP28705 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RxrgP28705 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RxrgP28705 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RxrgP28705 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RxrgP28705 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RxrgP28705 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RxrgP28705 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RxrgP28705 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RxrgP28705 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RxrgP28705 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RxrgP28705 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RxrgP28705 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RxrgP28705 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RxrgP28705 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RxrgP28705 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RxrgP28705 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RxrgP28705 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RxrgP28705 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RxrgP28705 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
RxrgP28705 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RxrgP28705 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RxrgP28705 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RxrgP28705 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RxrgP28705 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RxrgP28705 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RxrgP28705 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RxrgP28705 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RxrgP28705 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RxrgP28705 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RxrgP28705 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RxrgP28705 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RxrgP28705 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RxrgP28705 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RxrgP28705 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RxrgP28705 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RxrgP28705 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
RxrgP28705 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RxrgP28705 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RxrgP28705 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RxrgP28705 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RxrgP28705 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RxrgP28705 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RxrgP28705 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RxrgP28705 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RxrgP28705 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RxrgP28705 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RxrgP28705 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RxrgP28705 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RxrgP28705 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RxrgP28705 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RxrgP28705 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RxrgP28705 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RxrgP28705 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RxrgP28705 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RxrgP28705 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RxrgP28705 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
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