Protein–RNA interactions for Protein: P28357

Hoxd9, Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9P28357 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Hoxd9P28357 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Hoxd9P28357 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Hoxd9P28357 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Hoxd9P28357 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Hoxd9P28357 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Hoxd9P28357 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Hoxd9P28357 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Hoxd9P28357 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Hoxd9P28357 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Hoxd9P28357 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Hoxd9P28357 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Hoxd9P28357 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Hoxd9P28357 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Hoxd9P28357 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Hoxd9P28357 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Hoxd9P28357 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Hoxd9P28357 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Hoxd9P28357 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Hoxd9P28357 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Hoxd9P28357 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Hoxd9P28357 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Hoxd9P28357 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Hoxd9P28357 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Hoxd9P28357 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Hoxd9P28357 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Hoxd9P28357 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Hoxd9P28357 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Hoxd9P28357 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Hoxd9P28357 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Hoxd9P28357 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Hoxd9P28357 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Hoxd9P28357 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Hoxd9P28357 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Hoxd9P28357 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Hoxd9P28357 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Hoxd9P28357 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Hoxd9P28357 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Hoxd9P28357 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Hoxd9P28357 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Hoxd9P28357 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Hoxd9P28357 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Hoxd9P28357 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Hoxd9P28357 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Hoxd9P28357 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Hoxd9P28357 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Hoxd9P28357 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Hoxd9P28357 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Hoxd9P28357 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Hoxd9P28357 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Hoxd9P28357 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Hoxd9P28357 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Hoxd9P28357 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Hoxd9P28357 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Hoxd9P28357 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Hoxd9P28357 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Hoxd9P28357 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Hoxd9P28357 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Hoxd9P28357 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Hoxd9P28357 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Hoxd9P28357 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Hoxd9P28357 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Hoxd9P28357 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Hoxd9P28357 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Hoxd9P28357 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Hoxd9P28357 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Hoxd9P28357 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Hoxd9P28357 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Hoxd9P28357 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Hoxd9P28357 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Hoxd9P28357 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Hoxd9P28357 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Hoxd9P28357 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Hoxd9P28357 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Hoxd9P28357 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Hoxd9P28357 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Hoxd9P28357 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Hoxd9P28357 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Hoxd9P28357 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Hoxd9P28357 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Hoxd9P28357 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Hoxd9P28357 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Hoxd9P28357 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Hoxd9P28357 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Hoxd9P28357 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Hoxd9P28357 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Hoxd9P28357 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Hoxd9P28357 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Hoxd9P28357 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Hoxd9P28357 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Hoxd9P28357 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Hoxd9P28357 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Hoxd9P28357 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Hoxd9P28357 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Hoxd9P28357 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Hoxd9P28357 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Hoxd9P28357 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Hoxd9P28357 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Hoxd9P28357 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Hoxd9P28357 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms