Protein–RNA interactions for Protein: P28312

Defa5, Alpha-defensin 5, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa5P28312 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Defa5P28312 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Defa5P28312 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Defa5P28312 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Defa5P28312 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Defa5P28312 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Defa5P28312 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Defa5P28312 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Defa5P28312 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Defa5P28312 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Defa5P28312 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Defa5P28312 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Defa5P28312 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Defa5P28312 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Defa5P28312 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Defa5P28312 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Defa5P28312 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Defa5P28312 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Defa5P28312 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Defa5P28312 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Defa5P28312 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Defa5P28312 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Defa5P28312 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Defa5P28312 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Defa5P28312 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Defa5P28312 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Defa5P28312 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Defa5P28312 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Defa5P28312 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Defa5P28312 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Defa5P28312 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Defa5P28312 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Defa5P28312 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Defa5P28312 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Defa5P28312 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Defa5P28312 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Defa5P28312 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Defa5P28312 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Defa5P28312 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Defa5P28312 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Defa5P28312 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Defa5P28312 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Defa5P28312 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Defa5P28312 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Defa5P28312 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Defa5P28312 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Defa5P28312 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Defa5P28312 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Defa5P28312 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Defa5P28312 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Defa5P28312 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Defa5P28312 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Defa5P28312 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Defa5P28312 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Defa5P28312 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Defa5P28312 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Defa5P28312 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Defa5P28312 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Defa5P28312 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Defa5P28312 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Defa5P28312 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Defa5P28312 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Defa5P28312 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Defa5P28312 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Defa5P28312 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Defa5P28312 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Defa5P28312 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Defa5P28312 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Defa5P28312 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Defa5P28312 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Defa5P28312 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Defa5P28312 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Defa5P28312 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Defa5P28312 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Defa5P28312 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Defa5P28312 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Defa5P28312 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Defa5P28312 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Defa5P28312 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Defa5P28312 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Defa5P28312 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Defa5P28312 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Defa5P28312 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Defa5P28312 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Defa5P28312 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Defa5P28312 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Defa5P28312 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Defa5P28312 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Defa5P28312 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Defa5P28312 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Defa5P28312 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Defa5P28312 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Defa5P28312 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Defa5P28312 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Defa5P28312 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Defa5P28312 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Defa5P28312 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Defa5P28312 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Defa5P28312 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Defa5P28312 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms