Protein–RNA interactions for Protein: P28236

Gja8, Gap junction alpha-8 protein, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja8P28236 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gja8P28236 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gja8P28236 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gja8P28236 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gja8P28236 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gja8P28236 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gja8P28236 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Gja8P28236 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gja8P28236 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gja8P28236 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gja8P28236 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gja8P28236 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gja8P28236 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gja8P28236 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gja8P28236 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gja8P28236 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gja8P28236 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gja8P28236 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Gja8P28236 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Gja8P28236 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Gja8P28236 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Gja8P28236 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Gja8P28236 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gja8P28236 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gja8P28236 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gja8P28236 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gja8P28236 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Gja8P28236 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gja8P28236 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gja8P28236 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Gja8P28236 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Gja8P28236 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Gja8P28236 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Gja8P28236 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Gja8P28236 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Gja8P28236 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Gja8P28236 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Gja8P28236 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gja8P28236 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gja8P28236 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gja8P28236 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gja8P28236 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gja8P28236 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Gja8P28236 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Gja8P28236 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gja8P28236 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gja8P28236 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gja8P28236 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gja8P28236 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gja8P28236 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gja8P28236 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Gja8P28236 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Gja8P28236 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Gja8P28236 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gja8P28236 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gja8P28236 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gja8P28236 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gja8P28236 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gja8P28236 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gja8P28236 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Gja8P28236 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gja8P28236 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gja8P28236 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gja8P28236 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gja8P28236 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gja8P28236 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gja8P28236 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gja8P28236 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gja8P28236 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Gja8P28236 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gja8P28236 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gja8P28236 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Gja8P28236 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Gja8P28236 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Gja8P28236 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Gja8P28236 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Gja8P28236 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
Gja8P28236 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Gja8P28236 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Gja8P28236 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Gja8P28236 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Gja8P28236 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Gja8P28236 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gja8P28236 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gja8P28236 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gja8P28236 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gja8P28236 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gja8P28236 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gja8P28236 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Gja8P28236 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gja8P28236 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gja8P28236 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gja8P28236 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gja8P28236 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gja8P28236 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gja8P28236 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gja8P28236 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gja8P28236 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gja8P28236 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gja8P28236 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.4 ms