Protein–RNA interactions for Protein: P28231

Gjb3, Gap junction beta-3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb3P28231 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gjb3P28231 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gjb3P28231 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gjb3P28231 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gjb3P28231 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gjb3P28231 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gjb3P28231 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gjb3P28231 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gjb3P28231 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Gjb3P28231 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gjb3P28231 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gjb3P28231 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gjb3P28231 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gjb3P28231 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gjb3P28231 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gjb3P28231 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gjb3P28231 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gjb3P28231 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gjb3P28231 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gjb3P28231 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gjb3P28231 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gjb3P28231 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gjb3P28231 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gjb3P28231 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gjb3P28231 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gjb3P28231 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gjb3P28231 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gjb3P28231 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gjb3P28231 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gjb3P28231 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gjb3P28231 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gjb3P28231 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gjb3P28231 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gjb3P28231 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gjb3P28231 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gjb3P28231 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gjb3P28231 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gjb3P28231 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gjb3P28231 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gjb3P28231 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gjb3P28231 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gjb3P28231 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gjb3P28231 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gjb3P28231 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gjb3P28231 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gjb3P28231 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gjb3P28231 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gjb3P28231 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gjb3P28231 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gjb3P28231 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gjb3P28231 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Gjb3P28231 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gjb3P28231 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gjb3P28231 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gjb3P28231 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gjb3P28231 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gjb3P28231 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gjb3P28231 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gjb3P28231 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Gjb3P28231 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Gjb3P28231 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gjb3P28231 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gjb3P28231 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gjb3P28231 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gjb3P28231 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gjb3P28231 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gjb3P28231 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gjb3P28231 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Gjb3P28231 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Gjb3P28231 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gjb3P28231 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gjb3P28231 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gjb3P28231 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gjb3P28231 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gjb3P28231 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gjb3P28231 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gjb3P28231 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gjb3P28231 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Gjb3P28231 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gjb3P28231 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gjb3P28231 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gjb3P28231 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Gjb3P28231 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gjb3P28231 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gjb3P28231 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gjb3P28231 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gjb3P28231 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gjb3P28231 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gjb3P28231 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gjb3P28231 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gjb3P28231 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gjb3P28231 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
Gjb3P28231 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Gjb3P28231 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Gjb3P28231 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gjb3P28231 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gjb3P28231 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gjb3P28231 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gjb3P28231 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Gjb3P28231 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms