Protein–RNA interactions for Protein: P28078

H2-DMa, Class II histocompatibility antigen, M alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-DMaP28078 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
H2-DMaP28078 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
H2-DMaP28078 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
H2-DMaP28078 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
H2-DMaP28078 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
H2-DMaP28078 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
H2-DMaP28078 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
H2-DMaP28078 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
H2-DMaP28078 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
H2-DMaP28078 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
H2-DMaP28078 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
H2-DMaP28078 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
H2-DMaP28078 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
H2-DMaP28078 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
H2-DMaP28078 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
H2-DMaP28078 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
H2-DMaP28078 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
H2-DMaP28078 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
H2-DMaP28078 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
H2-DMaP28078 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
H2-DMaP28078 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
H2-DMaP28078 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
H2-DMaP28078 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
H2-DMaP28078 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
H2-DMaP28078 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
H2-DMaP28078 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
H2-DMaP28078 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
H2-DMaP28078 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
H2-DMaP28078 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
H2-DMaP28078 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
H2-DMaP28078 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
H2-DMaP28078 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
H2-DMaP28078 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
H2-DMaP28078 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
H2-DMaP28078 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC19■□□□□ 0.63
H2-DMaP28078 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
H2-DMaP28078 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
H2-DMaP28078 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
H2-DMaP28078 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
H2-DMaP28078 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
H2-DMaP28078 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
H2-DMaP28078 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
H2-DMaP28078 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
H2-DMaP28078 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
H2-DMaP28078 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
H2-DMaP28078 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
H2-DMaP28078 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
H2-DMaP28078 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
H2-DMaP28078 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
H2-DMaP28078 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
H2-DMaP28078 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
H2-DMaP28078 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
H2-DMaP28078 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
H2-DMaP28078 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
H2-DMaP28078 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
H2-DMaP28078 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
H2-DMaP28078 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
H2-DMaP28078 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
H2-DMaP28078 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
H2-DMaP28078 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
H2-DMaP28078 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
H2-DMaP28078 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
H2-DMaP28078 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
H2-DMaP28078 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
H2-DMaP28078 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
H2-DMaP28078 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
H2-DMaP28078 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
H2-DMaP28078 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
H2-DMaP28078 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
H2-DMaP28078 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
H2-DMaP28078 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
H2-DMaP28078 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
H2-DMaP28078 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
H2-DMaP28078 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
H2-DMaP28078 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
H2-DMaP28078 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
H2-DMaP28078 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
H2-DMaP28078 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
H2-DMaP28078 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
H2-DMaP28078 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
H2-DMaP28078 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
H2-DMaP28078 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
H2-DMaP28078 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
H2-DMaP28078 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
H2-DMaP28078 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
H2-DMaP28078 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
H2-DMaP28078 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
H2-DMaP28078 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
H2-DMaP28078 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
H2-DMaP28078 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
H2-DMaP28078 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
H2-DMaP28078 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
H2-DMaP28078 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
H2-DMaP28078 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
H2-DMaP28078 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
H2-DMaP28078 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
H2-DMaP28078 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
H2-DMaP28078 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
H2-DMaP28078 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
H2-DMaP28078 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.5 ms