Protein–RNA interactions for Protein: P26955

Csf2rb, Cytokine receptor common subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 896 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csf2rbP26955 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Csf2rbP26955 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Csf2rbP26955 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Csf2rbP26955 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Csf2rbP26955 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Csf2rbP26955 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Csf2rbP26955 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Csf2rbP26955 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Csf2rbP26955 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Csf2rbP26955 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Csf2rbP26955 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Csf2rbP26955 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Csf2rbP26955 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Csf2rbP26955 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Csf2rbP26955 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Csf2rbP26955 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Csf2rbP26955 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Csf2rbP26955 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Csf2rbP26955 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Csf2rbP26955 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Csf2rbP26955 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Csf2rbP26955 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Csf2rbP26955 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Csf2rbP26955 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Csf2rbP26955 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Csf2rbP26955 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Csf2rbP26955 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Csf2rbP26955 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Csf2rbP26955 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Csf2rbP26955 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Csf2rbP26955 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Csf2rbP26955 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Csf2rbP26955 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Csf2rbP26955 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Csf2rbP26955 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Csf2rbP26955 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Csf2rbP26955 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Csf2rbP26955 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Csf2rbP26955 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Csf2rbP26955 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Csf2rbP26955 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Csf2rbP26955 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Csf2rbP26955 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Csf2rbP26955 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Csf2rbP26955 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Csf2rbP26955 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Csf2rbP26955 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Csf2rbP26955 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Csf2rbP26955 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Csf2rbP26955 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Csf2rbP26955 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Csf2rbP26955 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Csf2rbP26955 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Csf2rbP26955 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Csf2rbP26955 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Csf2rbP26955 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Csf2rbP26955 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Csf2rbP26955 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Csf2rbP26955 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Csf2rbP26955 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Csf2rbP26955 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Csf2rbP26955 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Csf2rbP26955 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Csf2rbP26955 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Csf2rbP26955 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Csf2rbP26955 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Csf2rbP26955 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Csf2rbP26955 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Csf2rbP26955 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Csf2rbP26955 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Csf2rbP26955 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Csf2rbP26955 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Csf2rbP26955 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Csf2rbP26955 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Csf2rbP26955 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Csf2rbP26955 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Csf2rbP26955 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Csf2rbP26955 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Csf2rbP26955 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Csf2rbP26955 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Csf2rbP26955 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Csf2rbP26955 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Csf2rbP26955 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Csf2rbP26955 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Csf2rbP26955 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Csf2rbP26955 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Csf2rbP26955 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Csf2rbP26955 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Csf2rbP26955 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Csf2rbP26955 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Csf2rbP26955 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Csf2rbP26955 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Csf2rbP26955 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Csf2rbP26955 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Csf2rbP26955 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Csf2rbP26955 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Csf2rbP26955 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Csf2rbP26955 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Csf2rbP26955 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Csf2rbP26955 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms