Protein–RNA interactions for Protein: P25916

Bmi1, Polycomb complex protein BMI-1, mousemouse

Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bmi1P25916 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Bmi1P25916 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Bmi1P25916 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Bmi1P25916 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Bmi1P25916 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Bmi1P25916 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Bmi1P25916 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Bmi1P25916 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Bmi1P25916 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Bmi1P25916 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Bmi1P25916 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Bmi1P25916 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Bmi1P25916 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Bmi1P25916 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Bmi1P25916 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Bmi1P25916 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Bmi1P25916 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Bmi1P25916 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Bmi1P25916 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Bmi1P25916 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Bmi1P25916 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Bmi1P25916 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Bmi1P25916 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Bmi1P25916 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Bmi1P25916 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Bmi1P25916 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Bmi1P25916 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Bmi1P25916 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Bmi1P25916 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Bmi1P25916 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Bmi1P25916 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Bmi1P25916 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Bmi1P25916 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Bmi1P25916 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Bmi1P25916 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Bmi1P25916 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Bmi1P25916 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Bmi1P25916 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Bmi1P25916 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Bmi1P25916 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Bmi1P25916 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Bmi1P25916 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Bmi1P25916 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Bmi1P25916 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Bmi1P25916 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Bmi1P25916 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Bmi1P25916 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Bmi1P25916 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Bmi1P25916 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Bmi1P25916 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Bmi1P25916 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Bmi1P25916 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Bmi1P25916 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Bmi1P25916 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Bmi1P25916 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Bmi1P25916 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Bmi1P25916 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Bmi1P25916 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Bmi1P25916 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Bmi1P25916 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Bmi1P25916 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Bmi1P25916 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Bmi1P25916 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Bmi1P25916 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Bmi1P25916 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Bmi1P25916 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Bmi1P25916 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Bmi1P25916 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Bmi1P25916 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Bmi1P25916 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Bmi1P25916 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Bmi1P25916 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Bmi1P25916 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Bmi1P25916 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Bmi1P25916 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Bmi1P25916 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Bmi1P25916 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Bmi1P25916 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Bmi1P25916 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Bmi1P25916 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Bmi1P25916 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Bmi1P25916 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Bmi1P25916 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Bmi1P25916 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Bmi1P25916 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Bmi1P25916 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Bmi1P25916 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Bmi1P25916 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Bmi1P25916 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Bmi1P25916 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Bmi1P25916 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Bmi1P25916 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Bmi1P25916 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Bmi1P25916 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Bmi1P25916 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Bmi1P25916 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Bmi1P25916 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Bmi1P25916 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Bmi1P25916 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Bmi1P25916 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms