Protein–RNA interactions for Protein: P22605

Rarb, Retinoic acid receptor beta, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RarbP22605 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RarbP22605 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RarbP22605 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RarbP22605 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RarbP22605 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RarbP22605 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RarbP22605 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RarbP22605 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
RarbP22605 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RarbP22605 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RarbP22605 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RarbP22605 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
RarbP22605 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RarbP22605 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RarbP22605 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RarbP22605 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RarbP22605 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RarbP22605 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RarbP22605 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RarbP22605 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RarbP22605 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RarbP22605 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RarbP22605 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RarbP22605 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RarbP22605 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RarbP22605 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RarbP22605 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RarbP22605 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RarbP22605 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RarbP22605 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RarbP22605 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RarbP22605 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RarbP22605 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RarbP22605 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RarbP22605 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RarbP22605 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RarbP22605 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RarbP22605 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RarbP22605 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RarbP22605 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RarbP22605 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RarbP22605 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RarbP22605 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RarbP22605 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RarbP22605 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RarbP22605 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RarbP22605 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RarbP22605 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RarbP22605 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RarbP22605 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RarbP22605 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
RarbP22605 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RarbP22605 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RarbP22605 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RarbP22605 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RarbP22605 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RarbP22605 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RarbP22605 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RarbP22605 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RarbP22605 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RarbP22605 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RarbP22605 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RarbP22605 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RarbP22605 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RarbP22605 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RarbP22605 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RarbP22605 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RarbP22605 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RarbP22605 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RarbP22605 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RarbP22605 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RarbP22605 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RarbP22605 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RarbP22605 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RarbP22605 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RarbP22605 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RarbP22605 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RarbP22605 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
RarbP22605 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RarbP22605 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RarbP22605 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RarbP22605 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RarbP22605 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RarbP22605 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RarbP22605 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RarbP22605 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RarbP22605 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RarbP22605 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RarbP22605 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RarbP22605 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RarbP22605 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RarbP22605 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RarbP22605 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RarbP22605 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RarbP22605 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
RarbP22605 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RarbP22605 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RarbP22605 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RarbP22605 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RarbP22605 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms