Protein–RNA interactions for Protein: P13504

Il1r1, Interleukin-1 receptor type 1, mousemouse

Predictions only

Length 576 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Il1r1P13504 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Il1r1P13504 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Il1r1P13504 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Il1r1P13504 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Il1r1P13504 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Il1r1P13504 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Il1r1P13504 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Il1r1P13504 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Il1r1P13504 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Il1r1P13504 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Il1r1P13504 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Il1r1P13504 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Il1r1P13504 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Il1r1P13504 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Il1r1P13504 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Il1r1P13504 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Il1r1P13504 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Il1r1P13504 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Il1r1P13504 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Il1r1P13504 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Il1r1P13504 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Il1r1P13504 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Il1r1P13504 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Il1r1P13504 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Il1r1P13504 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Il1r1P13504 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Il1r1P13504 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Il1r1P13504 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Il1r1P13504 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Il1r1P13504 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Il1r1P13504 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Il1r1P13504 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Il1r1P13504 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Il1r1P13504 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Il1r1P13504 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Il1r1P13504 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Il1r1P13504 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Il1r1P13504 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Il1r1P13504 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Il1r1P13504 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Il1r1P13504 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Il1r1P13504 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Il1r1P13504 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Il1r1P13504 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Il1r1P13504 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Il1r1P13504 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Il1r1P13504 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Il1r1P13504 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Il1r1P13504 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Il1r1P13504 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Il1r1P13504 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Il1r1P13504 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Il1r1P13504 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Il1r1P13504 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Il1r1P13504 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Il1r1P13504 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Il1r1P13504 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Il1r1P13504 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Il1r1P13504 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Il1r1P13504 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Il1r1P13504 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Il1r1P13504 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Il1r1P13504 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Il1r1P13504 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Il1r1P13504 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Il1r1P13504 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Il1r1P13504 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Il1r1P13504 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Il1r1P13504 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Il1r1P13504 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Il1r1P13504 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Il1r1P13504 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Il1r1P13504 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Il1r1P13504 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Il1r1P13504 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Il1r1P13504 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Il1r1P13504 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Il1r1P13504 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Il1r1P13504 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Il1r1P13504 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Il1r1P13504 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Il1r1P13504 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Il1r1P13504 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Il1r1P13504 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Il1r1P13504 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Il1r1P13504 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Il1r1P13504 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Il1r1P13504 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Il1r1P13504 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Il1r1P13504 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Il1r1P13504 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Il1r1P13504 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Il1r1P13504 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Il1r1P13504 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Il1r1P13504 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Il1r1P13504 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Il1r1P13504 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Il1r1P13504 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Il1r1P13504 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Il1r1P13504 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.2 ms