Protein–RNA interactions for Protein: P07351

Ifna4, Interferon alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna4P07351 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ifna4P07351 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ifna4P07351 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ifna4P07351 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ifna4P07351 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ifna4P07351 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ifna4P07351 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ifna4P07351 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Ifna4P07351 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ifna4P07351 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ifna4P07351 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ifna4P07351 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ifna4P07351 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ifna4P07351 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ifna4P07351 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ifna4P07351 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ifna4P07351 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ifna4P07351 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ifna4P07351 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ifna4P07351 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ifna4P07351 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ifna4P07351 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ifna4P07351 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ifna4P07351 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ifna4P07351 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ifna4P07351 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ifna4P07351 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ifna4P07351 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ifna4P07351 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ifna4P07351 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ifna4P07351 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ifna4P07351 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ifna4P07351 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ifna4P07351 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ifna4P07351 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ifna4P07351 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ifna4P07351 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ifna4P07351 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ifna4P07351 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ifna4P07351 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ifna4P07351 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ifna4P07351 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ifna4P07351 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ifna4P07351 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ifna4P07351 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ifna4P07351 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ifna4P07351 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ifna4P07351 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Ifna4P07351 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Ifna4P07351 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ifna4P07351 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ifna4P07351 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ifna4P07351 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ifna4P07351 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ifna4P07351 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ifna4P07351 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ifna4P07351 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ifna4P07351 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ifna4P07351 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ifna4P07351 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ifna4P07351 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ifna4P07351 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ifna4P07351 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ifna4P07351 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ifna4P07351 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ifna4P07351 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ifna4P07351 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ifna4P07351 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ifna4P07351 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ifna4P07351 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Ifna4P07351 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ifna4P07351 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ifna4P07351 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ifna4P07351 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ifna4P07351 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ifna4P07351 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ifna4P07351 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ifna4P07351 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ifna4P07351 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ifna4P07351 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ifna4P07351 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ifna4P07351 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ifna4P07351 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ifna4P07351 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ifna4P07351 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ifna4P07351 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Ifna4P07351 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Ifna4P07351 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ifna4P07351 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ifna4P07351 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ifna4P07351 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Ifna4P07351 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ifna4P07351 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ifna4P07351 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ifna4P07351 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ifna4P07351 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ifna4P07351 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ifna4P07351 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ifna4P07351 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ifna4P07351 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12 ms