Protein–RNA interactions for Protein: P01810

Ig heavy chain V region J539, mousemouse

Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01810 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
P01810 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
P01810 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
P01810 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
P01810 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
P01810 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
P01810 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
P01810 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
P01810 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
P01810 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
P01810 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
P01810 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
P01810 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
P01810 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
P01810 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
P01810 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
P01810 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
P01810 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
P01810 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
P01810 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
P01810 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
P01810 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
P01810 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
P01810 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
P01810 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
P01810 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
P01810 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
P01810 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
P01810 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
P01810 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
P01810 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
P01810 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
P01810 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
P01810 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
P01810 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
P01810 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
P01810 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
P01810 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
P01810 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
P01810 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
P01810 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
P01810 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
P01810 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
P01810 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
P01810 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
P01810 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
P01810 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
P01810 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
P01810 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
P01810 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
P01810 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
P01810 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
P01810 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
P01810 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
P01810 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
P01810 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
P01810 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
P01810 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
P01810 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
P01810 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
P01810 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
P01810 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
P01810 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
P01810 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
P01810 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
P01810 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
P01810 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
P01810 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
P01810 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
P01810 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
P01810 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
P01810 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
P01810 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
P01810 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
P01810 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
P01810 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
P01810 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
P01810 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
P01810 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
P01810 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
P01810 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
P01810 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
P01810 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
P01810 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
P01810 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
P01810 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
P01810 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
P01810 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
P01810 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
P01810 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
P01810 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
P01810 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
P01810 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
P01810 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
P01810 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
P01810 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
P01810 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
P01810 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
P01810 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
P01810 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.1 ms