Protein–RNA interactions for Protein: P01666

Ig kappa chain V-III region PC 7183, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01666 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
P01666 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
P01666 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
P01666 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
P01666 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
P01666 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
P01666 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
P01666 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
P01666 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
P01666 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
P01666 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
P01666 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
P01666 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
P01666 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
P01666 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
P01666 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
P01666 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
P01666 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
P01666 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
P01666 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
P01666 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
P01666 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
P01666 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
P01666 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
P01666 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
P01666 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
P01666 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
P01666 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
P01666 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
P01666 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
P01666 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
P01666 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
P01666 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
P01666 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
P01666 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
P01666 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
P01666 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
P01666 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
P01666 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
P01666 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
P01666 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
P01666 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
P01666 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
P01666 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
P01666 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
P01666 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
P01666 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
P01666 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
P01666 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
P01666 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
P01666 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
P01666 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
P01666 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
P01666 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
P01666 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
P01666 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
P01666 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
P01666 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
P01666 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
P01666 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
P01666 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
P01666 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
P01666 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
P01666 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
P01666 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
P01666 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
P01666 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
P01666 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
P01666 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
P01666 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
P01666 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
P01666 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
P01666 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
P01666 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
P01666 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
P01666 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
P01666 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
P01666 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
P01666 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
P01666 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
P01666 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
P01666 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
P01666 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
P01666 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
P01666 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
P01666 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
P01666 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
P01666 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
P01666 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
P01666 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
P01666 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
P01666 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
P01666 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
P01666 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
P01666 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
P01666 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
P01666 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
P01666 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
P01666 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
P01666 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 126.8 ms