Protein–RNA interactions for Protein: P01575

Ifnb1, Interferon beta, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifnb1P01575 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ifnb1P01575 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ifnb1P01575 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ifnb1P01575 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ifnb1P01575 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ifnb1P01575 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ifnb1P01575 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ifnb1P01575 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ifnb1P01575 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ifnb1P01575 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ifnb1P01575 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ifnb1P01575 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Ifnb1P01575 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ifnb1P01575 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ifnb1P01575 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ifnb1P01575 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ifnb1P01575 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ifnb1P01575 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ifnb1P01575 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ifnb1P01575 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ifnb1P01575 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ifnb1P01575 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ifnb1P01575 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Ifnb1P01575 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ifnb1P01575 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Ifnb1P01575 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ifnb1P01575 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ifnb1P01575 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ifnb1P01575 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ifnb1P01575 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ifnb1P01575 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ifnb1P01575 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ifnb1P01575 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ifnb1P01575 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ifnb1P01575 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ifnb1P01575 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ifnb1P01575 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ifnb1P01575 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ifnb1P01575 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ifnb1P01575 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ifnb1P01575 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ifnb1P01575 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ifnb1P01575 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ifnb1P01575 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ifnb1P01575 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Ifnb1P01575 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ifnb1P01575 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ifnb1P01575 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ifnb1P01575 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ifnb1P01575 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ifnb1P01575 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ifnb1P01575 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Ifnb1P01575 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ifnb1P01575 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ifnb1P01575 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ifnb1P01575 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Ifnb1P01575 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ifnb1P01575 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ifnb1P01575 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ifnb1P01575 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ifnb1P01575 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ifnb1P01575 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ifnb1P01575 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ifnb1P01575 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ifnb1P01575 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ifnb1P01575 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ifnb1P01575 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ifnb1P01575 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ifnb1P01575 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ifnb1P01575 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ifnb1P01575 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ifnb1P01575 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ifnb1P01575 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ifnb1P01575 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ifnb1P01575 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ifnb1P01575 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ifnb1P01575 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ifnb1P01575 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Ifnb1P01575 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ifnb1P01575 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ifnb1P01575 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ifnb1P01575 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ifnb1P01575 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ifnb1P01575 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ifnb1P01575 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ifnb1P01575 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ifnb1P01575 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ifnb1P01575 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Ifnb1P01575 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ifnb1P01575 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ifnb1P01575 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ifnb1P01575 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ifnb1P01575 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ifnb1P01575 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ifnb1P01575 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ifnb1P01575 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ifnb1P01575 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ifnb1P01575 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ifnb1P01575 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ifnb1P01575 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 176.6 ms