Protein–RNA interactions for Protein: O89116

Vti1a, Vesicle transport through interaction with t-SNAREs homolog 1A, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vti1aO89116 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Vti1aO89116 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Vti1aO89116 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Vti1aO89116 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Vti1aO89116 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
Vti1aO89116 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Vti1aO89116 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Vti1aO89116 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Vti1aO89116 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Vti1aO89116 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Vti1aO89116 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Vti1aO89116 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Vti1aO89116 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Vti1aO89116 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Vti1aO89116 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Vti1aO89116 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Vti1aO89116 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Vti1aO89116 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Vti1aO89116 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Vti1aO89116 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Vti1aO89116 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Vti1aO89116 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Vti1aO89116 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Vti1aO89116 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Vti1aO89116 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Vti1aO89116 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Vti1aO89116 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Vti1aO89116 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Vti1aO89116 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Vti1aO89116 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Vti1aO89116 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Vti1aO89116 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Vti1aO89116 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Vti1aO89116 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Vti1aO89116 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Vti1aO89116 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Vti1aO89116 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Vti1aO89116 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Vti1aO89116 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Vti1aO89116 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Vti1aO89116 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Vti1aO89116 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Vti1aO89116 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Vti1aO89116 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Vti1aO89116 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Vti1aO89116 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Vti1aO89116 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Vti1aO89116 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Vti1aO89116 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Vti1aO89116 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Vti1aO89116 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Vti1aO89116 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Vti1aO89116 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Vti1aO89116 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Vti1aO89116 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Vti1aO89116 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Vti1aO89116 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Vti1aO89116 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Vti1aO89116 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Vti1aO89116 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Vti1aO89116 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Vti1aO89116 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Vti1aO89116 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Vti1aO89116 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Vti1aO89116 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Vti1aO89116 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Vti1aO89116 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Vti1aO89116 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Vti1aO89116 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Vti1aO89116 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Vti1aO89116 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Vti1aO89116 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Vti1aO89116 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Vti1aO89116 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Vti1aO89116 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Vti1aO89116 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Vti1aO89116 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Vti1aO89116 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Vti1aO89116 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Vti1aO89116 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Vti1aO89116 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Vti1aO89116 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Vti1aO89116 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Vti1aO89116 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Vti1aO89116 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Vti1aO89116 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Vti1aO89116 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Vti1aO89116 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Vti1aO89116 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Vti1aO89116 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Vti1aO89116 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Vti1aO89116 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Vti1aO89116 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Vti1aO89116 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Vti1aO89116 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Vti1aO89116 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Vti1aO89116 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Vti1aO89116 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Vti1aO89116 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Vti1aO89116 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.2 ms