Protein–RNA interactions for Protein: O88940

Msc, Musculin, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MscO88940 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
MscO88940 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
MscO88940 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MscO88940 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
MscO88940 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MscO88940 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
MscO88940 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MscO88940 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MscO88940 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MscO88940 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MscO88940 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MscO88940 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MscO88940 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MscO88940 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MscO88940 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MscO88940 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MscO88940 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MscO88940 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MscO88940 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MscO88940 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MscO88940 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MscO88940 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MscO88940 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MscO88940 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MscO88940 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MscO88940 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
MscO88940 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MscO88940 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MscO88940 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MscO88940 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MscO88940 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MscO88940 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MscO88940 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MscO88940 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MscO88940 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MscO88940 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MscO88940 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MscO88940 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MscO88940 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MscO88940 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MscO88940 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MscO88940 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MscO88940 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MscO88940 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MscO88940 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
MscO88940 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MscO88940 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MscO88940 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MscO88940 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MscO88940 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MscO88940 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MscO88940 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MscO88940 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MscO88940 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MscO88940 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
MscO88940 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MscO88940 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MscO88940 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MscO88940 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
MscO88940 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MscO88940 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MscO88940 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MscO88940 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MscO88940 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MscO88940 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MscO88940 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MscO88940 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MscO88940 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MscO88940 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MscO88940 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MscO88940 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MscO88940 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MscO88940 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MscO88940 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MscO88940 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MscO88940 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MscO88940 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MscO88940 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MscO88940 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MscO88940 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MscO88940 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MscO88940 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MscO88940 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MscO88940 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MscO88940 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MscO88940 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MscO88940 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MscO88940 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
MscO88940 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
MscO88940 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MscO88940 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MscO88940 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MscO88940 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MscO88940 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MscO88940 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MscO88940 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MscO88940 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MscO88940 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
MscO88940 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MscO88940 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.5 ms