Protein–RNA interactions for Protein: O88879

Apaf1, Apoptotic protease-activating factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apaf1O88879 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Apaf1O88879 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Apaf1O88879 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Apaf1O88879 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Apaf1O88879 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Apaf1O88879 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Apaf1O88879 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Apaf1O88879 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Apaf1O88879 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Apaf1O88879 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Apaf1O88879 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Apaf1O88879 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Apaf1O88879 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Apaf1O88879 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Apaf1O88879 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Apaf1O88879 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Apaf1O88879 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Apaf1O88879 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Apaf1O88879 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.28
Apaf1O88879 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.28
Apaf1O88879 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Apaf1O88879 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Apaf1O88879 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Apaf1O88879 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Apaf1O88879 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Apaf1O88879 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Apaf1O88879 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Apaf1O88879 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Apaf1O88879 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Apaf1O88879 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Apaf1O88879 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Apaf1O88879 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Apaf1O88879 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Apaf1O88879 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Apaf1O88879 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Apaf1O88879 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
Apaf1O88879 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Apaf1O88879 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
Apaf1O88879 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
Apaf1O88879 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Apaf1O88879 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Apaf1O88879 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Apaf1O88879 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Apaf1O88879 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Apaf1O88879 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Apaf1O88879 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Apaf1O88879 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Apaf1O88879 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Apaf1O88879 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Apaf1O88879 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
Apaf1O88879 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Apaf1O88879 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Apaf1O88879 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Apaf1O88879 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Apaf1O88879 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Apaf1O88879 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Apaf1O88879 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Apaf1O88879 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Apaf1O88879 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Apaf1O88879 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Apaf1O88879 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Apaf1O88879 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Apaf1O88879 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Apaf1O88879 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
Apaf1O88879 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Apaf1O88879 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Apaf1O88879 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Apaf1O88879 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Apaf1O88879 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Apaf1O88879 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Apaf1O88879 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Apaf1O88879 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Apaf1O88879 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Apaf1O88879 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Apaf1O88879 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Apaf1O88879 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Apaf1O88879 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Apaf1O88879 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Apaf1O88879 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
Apaf1O88879 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Apaf1O88879 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
Apaf1O88879 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Apaf1O88879 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Apaf1O88879 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Apaf1O88879 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
Apaf1O88879 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Apaf1O88879 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Apaf1O88879 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Apaf1O88879 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Apaf1O88879 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Apaf1O88879 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Apaf1O88879 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Apaf1O88879 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Apaf1O88879 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Apaf1O88879 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Apaf1O88879 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Apaf1O88879 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Apaf1O88879 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Apaf1O88879 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Apaf1O88879 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms